Клинические особенности метилирования генов микроРНК в пограничных опухолях яичников и в зависимости от гистологического строения злокачественных опухолей яичников

Полный текст

К пограничным опухолям яичников (ПОЯ), также известным как атипически пролиферирующие опухоли, относят новообразования, которые характеризуются атипичной эпителиальной пролиферацией и не имеют инвазии в строму. Данный тип опухоли в большинстве случаев имеет благоприятный прогноз и редко склонен к злокачественной трансформации [1, 2]. Из всех эпителиальных новообразований яичников на ПОЯ приходится 15–20%. К наиболее распространенным типам ПОЯ относятся серозные (53%) и муцинозные (43%). Другие типы, в том числе пограничные эндометриоидные, светлоклеточные и опухоли Бреннера, обнаруживают лишь в 4% наблюдений [3]. Серозные ПОЯ имеют общие молекулярные и генетические черты с серозными карциномами низкой степени злокачественности и могут присутствовать на более тяжелых стадиях рака с перитонеальными имплантатами и/или поражением лимфатических узлов, что подтверждает их злокачественный потенциал. ПОЯ так называемых несерозных гистологических типов, к которым относятся муцинозные, эндометриоидные, светлоклеточные и Бреннера, обычно характеризуются односторонней локализацией без имплантации в перитонеальное пространство и благоприятным прогнозом [2–4].

К настоящему времени накоплена обширная информация о влиянии аномальной экспрессии микроРНК (миРНК) на развитие и прогрессию рака яичников. Однако имеются ограниченные данные о дифференциальном паттерне этой экспрессии, связанном с гистологическими типами рака яичников, и единичные сообщения о паттерне экспрессии миРНК и в доброкачественных опухолях яичников, и в пограничных [5–7]. Так, миРНК, специфичные для ПОЯ, были наиболее подробно изучены в работе [5], где экспрессия 4 миРНК (miR-30c, miR-30d, miR-30e-3p, miR-370) значительно различалась между карциномами и доброкачественными опухолями яичников, а также между карциномой и пограничными опухолями. Еще 3 миРНК (miR-181d, miR-30a-3p, miR-532-5p) значительно различались только между ПОЯ и карциномами. Экспрессия miR-532-5p была существенно ниже в пограничных опухолях, чем в доброкачественных. Среди карцином яичников экспрессия 4 миРНК (miR-30a-3p, miR-30c, miR-30d, miR-30e-3p) была самой низкой в муцинозной и самой высокой в образцах светлоклеточной карциномы. В работе [8] обнаружено, что экспрессия miR-106b, напротив, значительно выше в нормальных тканях яичников и доброкачественных опухолях, чем в карциномах яичников и пограничных опухолях (p < 0,01). Коллективом авторов [9] проведен анализ экзосомных миРНК в сыворотке 68 новообразований яичников, включая доброкачественные кисты яичников (n = 10), ПОЯ (n = 10), серозные карциномы яичников высокой (n = 39) и низкой (n = 9) степени дифференцировки, что позволило отобрать экзосомные миРНК miR-93, miR-145 и miR-200c со значимо повышенным уровнем экспрессии в сыворотке больных раком яичников. Сывороточные экзосомальные miR-145 и miR-200c отобраны как биомаркеры для предоперационной диагностики карцином яичников [9].

Отмечено, что промоторные CpG-островки генов миРНК аберрантно метилируются, подобно генам, кодирующим белок, и что процент генов, дерегулируемых с помощью аберрантного метилирования, значительно выше среди первых генов, чем среди вторых [10]. Ранее нами показана высокая эффективность анализа метилирования генов миРНК для оценки степени развития и прогрессии рака яичников и определены наборы маркеров для диагностики и прогноза рака яичников [11–13]. В данной работе впервые проведен поиск аберрантно метилированных генов миРНК, специфичных для ПОЯ и некоторых гистологических подтипов рака яичников. Скрининг биомаркеров ПОЯ выполнен среди 21 гена миРНК.

Материал и методы

Клинический материал

Образцы рака яичников собраны и морфологически охарактеризованы в ФГБУ «НМИЦ онкологии им. Н.Н. Блохина» Минздрава России. В исследование включено 93 больных злокачественными опухолями яичников (ЗОЯ) в возрасте 25–81 года, а также 6 больных ПОЯ в возрасте 14–39 лет, проходивших обследование и лечение в ФГБУ «НМИЦ онкологии им. Н.Н. Блохина» Минздрава России в период с 1995 по 2019 г. Использовали материал от пациенток, которые до операции не получали лучевую, химио- или гормонотерапию. Диагноз установлен на основании гистологического заключения. В качестве контроля взяты образцы ткани яичников 15 женщин, умерших без признаков онкологических заболеваний по данным анамнеза.

Исследование выполнено в соответствии с этическими нормами Хельсинкской декларации Всемирной медицинской ассоциации (1964, 2004), все пациенты подписали информированное добровольное согласие. Все опухоли яичников классифицированы в соответствии с TNM-классификацией Международного противоракового союза и гистологически верифицированы на основании критериев классификации Всемирной организации здравоохранения [14]. Исследование выполнено по международным правилам работы с биоматериалом людей. ФГБНУ «Научно-исследовательский институт общей патологии и патофизиологии» получено соглашение от 20.01.2020 № 20/1 о взаимном сотрудничестве с ФГБУ «НМИЦ онкологии им. Н.Н. Блохина» Минздрава России.

В табл. 1 приведены количественные данные по гистологическому составу ЗОЯ всех исследованных образцов. Для отбора образцов с высоким содержанием опухолевых клеток (не менее 70–80%) проводили дополнительный гистологический анализ микросрезов (3–5 мкм), окрашенных гематоксилином и эозином. Образцы тканей хранили при -70 °С.

 

Таблица 1. Распределение больных злокачественными опухолями яичников в зависимости от гистологического варианта строения опухоли

Гистологический вариант	Частота, абс. (%)
Серозная аденокарцинома	44 (47,3)
Серозная цистаденокарцинома	38 (40,9)
Муцинозная цистаденокарцинома	1 (1,0)
Эндометриоидная аденокарцинома	10 (10,8)

 

Методы

Полученные в ходе биопсии или оперативного вмешательства образцы объемом до 100 мм³ измельчали с использованием гомогенизатора-диспергатора Ultra-Turrax T10 basic (IKA, Германия). Высокомолекулярную ДНК выделяли из ткани по стандартной методике с применением фенол-хлороформной экстракции. Качество и концентрацию ДНК определяли по оптической плотности на спектрофотометре NanoDrop ND-1000 (Thermo Fisher Scientific, США). Уровень метилирования генов миРНК анализировали методом количественной метилспецифичной полимеразной цепной реакции с детекцией в реальном времени с применением бисульфитной конверсии ДНК (0,5‒2,0 мкг), как описано в работах [15–18]. Набор реактивов qPCRmix-HS SYBR («Евроген», Россия) использовали в соответствии с рекомендациями производителя. Амплификацию проводили в системе CFX96 Touch Real-Time PCR Detection System (Bio-Rad, США) по протоколу производителя. Последовательности олигонуклеотидов и условия проведения полимеразной цепной реакции для исследованных генов миРНК взяты из работ [12, 16, 19]. Полноту конверсии ДНК определяли с помощью контрольного локуса гена ACTB с применением олигонуклеотидов, специфичных к неконвертированной матрице [16]. В качестве контролей для неметилированных аллелей использовали коммерческий препарат ДНК #G1471 (Promega, США). В качестве положительного контроля 100%-го метилирования применяли коммерческий препарат ДНК #SD1131 (Thermo Fisher Scientific).

Для статистической обработки полученных данных использовали программы IBM SPSS Statistics 22 и STATISTICA 10. Она включала определение медианы (Ме), интерквартильного размаха [Q1; Q3] и минимального и максимального значений (min–max). Для оценки статистической значимости различий применялись непараметрические критерии Манна – Уитни и Краскела – Уоллиса. Различия считали статистически значимыми при р < 0,05.

Результаты и обсуждение

Гены микроРНК, специфично гиперметилированные в пограничных опухолях яичников

В табл. 2 обобщены результаты анализа метилирования 21 гена миРНК в образцах ПОЯ, ЗОЯ и группы контроля. Оказалось, что уровни метилирования 8 генов миРНК, а именно MIR124-2, MIR124-3, MIR127, MIR137, MIR375, MIR9-1, MIR9-3, MIR130B, были выше в группе ЗОЯ в сравнении с группой ПОЯ и группой контроля (рис. 1). Интересно, что значения медиан 6 других генов – MIR129-2, MIR132, MIR148A, MIR203, MIR107 и MIR1258 – были, наоборот, выше в группе ПОЯ, чем ЗОЯ (см. табл. 2). При этом различия в уровнях метилирования гена MIR148A в группах ПОЯ и ЗОЯ статистически значимы (p = 0,047, рис. 2, см. табл. 2), а в группах больных ЗОЯ и контроля – незначимы (7,9 против 5,0). На основании этих данных можно предположить специфическую роль гена MIR148A в развитии ПОЯ.

 

Таблица 2. Данные анализа метилирования генов микроРНК в образцах ткани яичников разных групп больных и группы контроля

Ген MIR	Метилирование в ткани яичников, Ме [Q1; Q3], min–max, %			Значение p* (FDR = 0,01)
	Контроль (n = 15)	Ткань опухоли яичников
		ПОЯ (n = 6)	ЗОЯ (n = 93)
124-1	0,5 [0, 2; 3, 1], 0,1–9,2	14,0 [8, 9; 24, 0], 8,8–45,0	10,0 [2, 6; 21, 6], 0–67,3	p0–2 < 0,0001 p0–1 = 0,003
124-2	7,4 [0, 2; 13, 1], 0,1–19,5	19,0 [11, 0; 36, 5], 6,4–92,3	29,0 [6, 8; 51, 7], 0–98,1	p0–2 = 0,0017
124-3	4,7 [0, 3; 8, 9], 0,1–17,8	16,8 [12, 7; 30, 9], 9,6–34,6	21,4 [8, 5; 41, 7], 0,04–95,3	p0–2 < 0,0001
125B-1	5,6 [1, 6; 11, 4], 1,1–16,2	36,6 [1, 5; 75, 1], 0,4–97,3	34,8 [11, 2; 60, 6], 0,1–99,3	p0–2 < 0,0001
127	8,8 [0, 9; 11, 1]; 0,2–18,8	12,7 [1, 6; 20, 4], 1,0–31,0	27,6 [4, 8; 53, 9], 0,08–93,3	p0–2 < 0,001
129-2**	8,2 [4, 9; 11, 2], 4,3–13,3	51,6 [12, 7; 87, 4], 2,1–89,0	31,2 [10, 3; 51, 5], 0,3–99,3	p0–2 < 0,001 p0–1 = 0,036
132**	1,3 [0, 1; 4, 3], 0,1–9,0	25,6 [7, 6; 47, 2], 0,2–62,5	9,8 [3, 6; 31, 9], 0,05–98,8	p0–2 < 0,0001 p0–1 = 0,008
137	7,5 [2, 9; 10, 0], 0,3–13,2	22,9 [1, 8–76, 7], 1,0–90,0	31,1 [2, 5; 56, 9], 0–98,5	p0–2 = 0,018
148A**	5,0 [3, 0; 10, 9], 0,1–13,6	31,3 [25, 0; 50, 0], 9,9–90,8	7,9 [1, 9; 28, 7], 0–94,4	p0–1 = 0,018 p1–2 = 0,047
191	28,5 [13, 8; 32, 9], 8,6–94,4	4,8 [1, 8; 22, 2], 1,7–33,8	7,0 [2, 4; 25, 8], 0,01–90,7	p0–2 = 0,006
193A	4,5 [0, 3; 7, 3], 0,1–12,2	32,1 [8, 5; 38, 3], 0,1–53,1	34,8 [15, 4; 56, 4], 0,1–98,4	p0–2 < 0,0001
203**	6,9 [0, 9; 9, 9], 0,1–15,2	13,8 [0, 6; 74, 5], 0,2–90,9	6,8 [1, 3; 35, 3], 0,01–98,2	–
212	4,6 [1, 6; 8, 3], 0,2–13,9	5,9 [0, 4; 17, 8], 0,03–70,5	4,8 [1, 5; 12, 6], 0,02–98,2	–
34B/C	0,9 [0, 4; 1, 7], 0,1–7,7	21,3 [11, 4; 27, 4], 3,7–76,2	17,6 [3, 1; 35, 4], 0,01–98,1	p0–2 < 0,0001 p0–1 = 0,005
375	1,0 [0, 2; 2, 8], 0,1–9,1	7,8 [2, 2; 15, 0], 0,01–28,2	10,9 [3, 2; 34, 2], 0–92,5	p0–2 < 0,001
9-1	2,0 [1, 4; 4, 0], 0,1–8,8	7,3 [4, 0; 10, 0], 0,05–94,6	24,4 [7, 7; 56, 3], 0,01–93,6	p0–2 < 0,0001
9-3	7,4 [5, 2; 14, 9], 0–18,0	10,7 [5, 4; 24, 8], 2,1–36,5	21,9 [7, 2; 36, 4], 0,02–98,3	p0–2 = 0,014
130B	1,6 [0, 3; 2, 9], 0–7,2	7,8 [1, 6; 28, 2], 1,4–91,4	16,9 [6, 8; 32, 5], 0,1–99,1	p0–2 < 0,0001
107**	7,2 [2, 4; 10, 2], 1,6–17,4	26,1 [18, 2; 31, 1], 3,5–92,3	15,7 [6, 2; 53, 5], 0–93,0	p0–2 = 0,024
1258**	1,0 [0, 3; 12, 2], 0,2–14,1	35,6 [17, 0; 62, 2], 4,2–70,2	11,2 [4, 4; 40, 8], 0,1–90,8	p0–2 < 0,001 p0–1 = 0,002
339	7,9 [3, 2; 9, 4], 1,2–11,8	23,6 [9, 2; 48, 1], 8,2–99,9	21,2 [8, 2; 54, 3], 0,2–99,7	p0–2 < 0,001 p0–1 = 0,009

FDR – false discovery rate, ожидаемая доля ложных отклонений, ЗОЯ – злокачественные опухоли яичников; ПОЯ – пограничные опухоли яичников

p_0–1 – различия между группой контроля и группой больных ПОЯ, p_0–2 – различия между группой контроля и группой больных ЗОЯ, p_1–2 – различия между группой больных ПОЯ и группой больных ЗОЯ

^* Представлены только статистически значимые различия

^** Гены, у которых значения медиан существенно выше в ПОЯ, чем в ЗОЯ

 

Рис. 1. Медианы уровней метилирования 8 генов миРНК в группе больных злокачественными опухолями яичников (ЗОЯ) в сравнении с больными с пограничными опухолями яичников (ПОЯ) и группой контроля

 

Рис. 2. Уровни метилирования гена MIR148A в ткани яичников в группе контроля (0), группе больных пограничными опухолями яичников (1) и группе больных злокачественными опухолями яичников (2)

 

При сравнении группы контроля и больных ПОЯ статистически значимые различия установлены для 7 из 21 изучаемого гена (р < 0,05, рис. 3). Отметим: 10 генов миРНК (MIR124-1, MIR125B-1, MIR129-2, MIR132, MIR148A, MIR193A, MIR203A, MIR107, MIR1258, MIR339) характеризовались высоким уровнем метилирования в опухолях больных ПОЯ в сравнении с тканями яичников здоровых женщин, в отсутствие значимого изменения в группе больных ЗОЯ (рис. 4).

 

Рис. 3. Медианы и квартили уровней метилирования ряда генов в группе контроля (0) и группе больных пограничными опухолями яичников (1)

 

Рис. 4. Повышенные уровни метилирования 10 генов миРНК в группе больных пограничными опухолями яичников (ПОЯ) в сравнении как с группой контроля, так и с группой больных злокачественными опухолями яичников (ЗОЯ) (кроме MIR193А)

 

Наиболее существенное повышение (в 1,5–4 раза) уровня метилирования в образцах больных ПОЯ в сравнении с образцами больных ЗОЯ отмечено для 6 генов миРНК: MIR129-2, MIR132, MIR148A, MIR203, MIR107 и MIR1258 (см. табл. 2, рис. 4), что указывает на специфичную вовлеченность этих миРНК в патогенез ПОЯ. Повышенное метилирование данных супрессорных генов снижает их экспрессию и может увеличивать злокачественный потенциал ПОЯ.

Подобные попытки изучения статуса метилирования предпринимались и ранее при исследовании белок-кодирующих генов при раке яичников [20–22]. При этом существенных различий в статусе метилирования генов, кодирующих белки, в группах ПОЯ и ЗОЯ выявлено не было. Вместе с тем на данный момент нет ни одной публикации, в которой выполнен количественный анализ уровня метилирования миРНК в группах ПОЯ и ЗОЯ (поиск велся по базе PubMed, дата обращения: 14.10.2021). Наши результаты, свидетельствующие о существенно повышенном метилировании 6 генов миРНК (MIR129-2, MIR132, MIR148A, MIR203, MIR107 и MIR1258, при этом различия в уровнях метилирования гена MIR148A статистически значимы) в группе ПОЯ, получены впервые. Таким образом, нами выявлены новые эпигенетические факторы, которые могут оказывать влияние на развитие и степень злокачественности ПОЯ и служить их биомаркерами. Обнаруженные нами новые эпигенетические регуляторные факторы и биомаркеры ПОЯ могут найти применение для целей диагностики и профилактики рака яичников. Эти данные могут быть использованы в клинике как критерии течения болезни и, как следствие, для изменения тактики лечения.

Сравнение уровней метилирования генов миРНК в злокачественных опухолях яичников в зависимости от гистологического типа опухоли

Проведено сравнение уровней метилирования 21 гена миРНК в опухолях яичников 4 гистологических типов: серозная аденокарцинома, серозная цистаденокарцинома, муцинозная цистаденокарцинома и эндометриоидная аденокарцинома (табл. 3).

 

Таблица 3. Метилирование группы генов миРНК в образцах злокачественных опухолей яичников в зависимости от гистологического варианта строения опухоли

Ген MIR	Метилирование в опухолевой ткани яичников, Ме [Q1; Q3], %
	Гистологический вариант строения опухоли
	САК (n = 44)	СЦАК (n = 38)	ЭАК (n = 10)	МЦАК (n = 1)
124-1	11,4 [3, 3; 21, 0]	10,0 [2, 6; 30, 0]	3,8 [0, 4; 21, 2]	2,1
124-2	42,0 [7, 2; 66, 7]	21,2 [6, 8; 37, 2]	11,7 [3, 0; 41, 2]	0
124-3	21,3 [11, 9; 35, 8]	18,8 [4, 8; 50, 3]	28,8 [8, 6; 39, 8]	52,7
125B-1	32,8 [11, 2; 57, 6]	35,5 [13, 0; 69, 1]	33,4 [11, 2; 85, 0]	7,1
127	35,9 [5, 1; 56, 1]	18,8 [3, 9; 45, 0]	34,5 [18, 2; 45, 1]	54,3
129-2	32,1 [7, 6; 46, 6]	39,4 [12, 5; 84, 3]	23,0 [15, 2; 31, 2]	2,9
132	9,4 [4, 5; 16, 9]	11,5 [3, 6; 57, 3]	11,7 [1, 9; 35, 3]	0,1
137	36,6 [8, 0; 53, 1]	33,3 [2, 0; 60, 1]	12,7 [1, 0; 64, 4]	2,3
148A*	11,4 [5, 9; 34, 9]	2,4 [1, 1; 10, 1]	30,4 [7, 2; 45, 8]	1,9
191*	14,7 [4, 9; 28, 8]	2,4 [0, 7; 7, 0]	32,0 [11, 2; 42, 0]	21,3
193A	27,6 [14, 5; 54, 3]	42,3 [9, 0; 59, 7]	38,7 [24, 9; 66, 4]	34,6
203А	6,1 [0, 9; 33, 7]	10,3 [2, 6; 40, 9]	3,0 [1, 0; 37, 6]	1,3
212	8,7 [1, 6; 13, 6]	2,9 [1, 1; 7, 4]	9,5 [0, 5; 31, 1]	2,6
34B/C	12,7 [3, 8; 29, 8]	23,1 [2, 3; 49, 2]	11,2 [1, 3; 15, 7]	31,3
375	9,8 [0, 5; 36, 7]	11,3 [4, 3; 37, 6]	10,8 [8, 1; 18, 0]	1,6
9-1	25,6 [10, 6; 53, 8]	38,2 [3, 0; 63, 6]	20,0 [2, 2; 24, 2]	2,0
9-3**	15,8 [5, 9; 23, 9]	31,3 [13, 5; 52, 2]	16,0 [4, 6; 45, 1]	3,1
130B	16,1 [7, 3; 23, 9]	22,2 [6, 8; 48, 2]	15,1 [4, 5; 39, 0]	1,9
107	10,5 [5, 8; 56, 9]	22,2 [6, 2; 44, 5]	26,3 [8, 3; 59, 2]	2,7
1258**	8,2 [3, 9; 27, 2]	25,1 [7, 1; 56, 2]	5,0 [3, 5; 8, 0]	27,2
339	18,7 [2, 7; 49, 3]	21,1 [11, 2; 59, 1]	22,0 [12, 0; 26, 5]	44,6

МЦАК – муцинозная цистаденокарцинома, САК – серозная аденокарцинома, СЦАК – серозная цистаденокарцинома, ЭАК – эндометриоидная аденокарцинома

^* p < 0,001, FDR (false discovery rate, ожидаемая доля ложных отклонений) = 0,01

^** p < 0,05, FDR (false discovery rate, ожидаемая доля ложных отклонений) = 0,01

 

Наша выборка образцов представлена в основном серозной аденокарциномой (44 образца, 47,3%) и серозной цистаденокарциномой (38 образцов, 40,9%), которые составляют в сумме 82% исследованных ЗОЯ. Другие гистотипы присутствуют в меньшем количестве. Метилирование большинства генов распределено случайным образом между четырьмя гистологическими типами ЗОЯ, однако метилирование двух генов миРНК – MIR148A и MIR191 – имеет особенности и значимо связано со специфичными гистологическими вариантами рака яичников. Так, уровень метилирования гена MIR148A в группе больных серозной цистаденокарциномой статистически значимо меньше (2,4%) по сравнению как с вариантом серозной аденокарциномы (11,4%, р = 0,0003), так и с вариантом эндометриоидной аденокарциномы (30,4%, р = 0,0011, рис. 5). Аналогичная закономерность получена и при сравнении медиан метилирования гена MIR191. Так, в группе больных с вариантом серозной цистаденокарциномы медиана метилирования была статистически значимо меньше (2,4%) по сравнению с группами пациенток как с серозной аденокарциномой (14,7%, р = 0,0002), так и с эндометриоидной аденокарциномой (32%, р = 0,0003, см. рис. 5). У этих двух генов – MIR148A и MIR191 – втрое возрастает уровень метилирования у больных эндометриоидной аденокарциномой (приблизительно от 10 до 30%).

 

Рис. 5. Медианы метилирования генов микроРНК в ткани опухоли больных раком яичников, значимо связанных с гистологическим вариантом строения опухоли; САК – серозная аденокарцинома, СЦАК – серозная цистаденокарцинома, ЭАК – эндометриоидная аденокарцинома

 

Ген MIR191 подвергается в ЗОЯ деметилированию, то есть проявляет онкогенные свойства, что принципиально отличает его от остальных исследованных нами генов миРНК, гиперметилированных в ЗОЯ.

На основании наших результатов, в том числе особенностей, выявленных для гена MIR148A, можно предположить его двойственную природу. Под этим следует понимать тканеспецифичность данного гена и его способность быть как онкогеном, провоцируя развитие опухоли, так и супрессором, соответственно, подавляя ее. В этом свете интересной представляется роль метилирования как механизма дерегуляции данной миРНК, который может обусловливать ее двойственную природу.

Интересно отметить, что у гена MIR148A выше уровень метилирования у больных с серозной и эндометриоидной аденокарциномой, но этот ген значимо деметилирован в опухолях больных с серозной цистаденокарциномой. При этом именно ген MIR148A показал статистически значимо более высокий уровень метилирования в ПОЯ. Ранее для этого гена нами также выявлено резкое повышение метилирования при колонизации вторичных опухолей, перитонеальных макроскопических метастазов рака яичников [23]. Как известно, в процессах метастазирования наибольшее значение имеет эпителиально-мезенхимальный переход. Однако при закреплении метастатических клеток в метастатической нише может происходить обратный мезенхимально-эпителиальный переход. Эти переходы могут быть обратимы, и наибольшая пластичность отмечена при метастазировании именно рака яичников [24, 25].

В свете представленных здесь результатов важно, что в регуляции процессов обратимых эпителиально-мезенхимального – мезенхимально-эпителиального переходов и их пластичности ключевая роль отводится эпигенетическим факторам [26, 27]. При этом среди данных факторов важное значение в регуляции биологических процессов, связанных с перепрограммированием клеток опухолей яичников, могут иметь некодирующие РНК, в частности миРНК, и метилирование генов миРНК [12, 28]. С этой концепцией согласуется и открытый нами недавно эффект снижения гиперметилирования ряда генов длинных некодирующих РНК в перитонеальных макроскопических метастазах рака яичников, что также указывает на значение аберрантного метилирования длинных некодирующих РНК как эпигенетического фактора в реверсии эпителиально-мезенхимальный – мезенхимально-эпителиальный переходы при колонизации метастазов рака яичников в брюшине [29].

Обнаруженные в данной работе гиперметилирование генов миРНК в группе ПОЯ и различия уровней метилирования генов миРНК в гистологических вариантах ЗОЯ также указывают на потенциальную регуляторную роль эпигенетических факторов в биологических процессах, определяющих перепрограммирование клеток яичников, а также на вовлеченность метилирования ряда генов миРНК в клинические проявления ПОЯ и гистологические варианты ЗОЯ.

Заключение

В данной работе впервые выявлены ассоциации метилирования генов MIR148A и MIR191 со специфичными гистологическими вариантами рака яичников. Для группы генов миРНК, включая MIR148A, установлено повышение метилирования у больных ПОЯ в сравнении как со здоровыми женщинами, так и с больными ЗОЯ. В целом полученные результаты подтверждают регуляторную роль эпигенетических факторов в процессах формирования различных клинических фенотипов рака яичников.

Дополнительная информация

Финансирование

Работа выполнена за счет финансирования Российским научным фондом, грант № 20-15-00368.

Конфликт интересов

Авторы декларируют отсутствие явных и потенциальных конфликтов интересов, связанных с публикацией настоящей статьи.

Участие авторов

С.С. Лукина – проведение экспериментальных исследований; А.М. Бурденный – дизайн экспериментальной части исследования, анализ результатов, написание, редактирование и утверждение итогового варианта текста; Е.А. Филиппова – статистическая обработка данных, проведение экспериментальных исследований; И.В. Пронина – проведение экспериментальных исследований; Т.П. Казубская, Д.Н. Кушлинский и Д.О. Уткин – сбор и обработка материала; Э.А. Брага – концепция и дизайн исследования, написание, редактирование и утверждение итогового варианта текста; В.И. Логинов – анализ результатов, написание, редактирование и утверждение итогового варианта текста; Н.Е. Кушлинский – концепция статьи, анализ клинико-экспериментальных результатов исследования. Все авторы прочли и одобрили финальную версию статьи перед публикацией, согласны нести ответственность за все аспекты работы и гарантируют, что ими надлежащим образом были рассмотрены и решены вопросы, связанные с точностью и добросовестностью всех частей работы.

Об авторах

Светлана Сергеевна Лукина

ФГБНУ «Научно-исследовательский институт общей патологии и патофизиологии»

Email: sveta_sergeevna349@mail.ru
ORCID iD: 0000-0001-6246-2444

науч. сотр. лаборатории патогеномики и транскриптомики

Россия, 125315, г. Москва, ул. Балтийская, 8

Алексей Михайлович Бурденный

ФГБНУ «Научно-исследовательский институт общей патологии и патофизиологии»

Email: burdennyy@gmail.com
ORCID iD: 0000-0002-9398-8075

канд. биол. наук, вед. науч. сотр. лаборатории патогеномики и транскриптомики

Россия, 125315, г. Москва, ул. Балтийская, 8

Елена Александровна Филиппова

ФГБНУ «Научно-исследовательский институт общей патологии и патофизиологии»

Email: p.lenyxa@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0001-7172-0433

канд. мед. наук, науч. сотр. лаборатории патогеномики и транскриптомики

Россия, 125315, г. Москва, ул. Балтийская, 8

Ирина Валерьевна Пронина

ФГБНУ «Научно-исследовательский институт общей патологии и патофизиологии»

Email: zolly_sten@mail.ru
ORCID iD: 0000-0002-0423-7801

канд. биол. наук, ст. науч. сотр. лаборатории патогеномики и транскриптомики

Россия, 125315, г. Москва, ул. Балтийская, 8

Татьяна Павловна Казубская

ФГБУ «Национальный медицинский исследовательский центр онкологии имени Н.Н. Блохина» Минздрава России

Email: oncogen5@ronc.ru
ORCID iD: 0000-0001-5856-0017

д-р мед. наук, врач-онкогенетик высшей категории, ст. науч. сотр. лаборатории клинической онкогенетики

Россия, 115478, г. Москва, Каширское шоссе, 23

Дмитрий Николаевич Кушлинский

ФГБУ «Национальный медицинский исследовательский центр онкологии имени Н.Н. Блохина» Минздрава России

Email: biochimia@yandex.ru

врач-онколог, лаборатория клинической биохимии и лабораторной диагностики

Россия, 115478, г. Москва, Каширское шоссе, 23

Дмитрий Олегович Уткин

ГБУЗ г. Москвы «Московская городская онкологическая больница № 62 ДЗМ»

Email: burdennyy@gmail.com

врач-хирург первой квалификационной категории, отделение онкогинекологии

Россия, 143423, Красногорский район, пос. Истра, 27

Элеонора Александровна Брага

ФГБНУ «Научно-исследовательский институт общей патологии и патофизиологии»

Автор, ответственный за переписку.
Email: eleonora10_45@mail.ru
ORCID iD: 0000-0001-5188-4094

д-р биол. наук, профессор, гл. науч. сотр., заведующая лабораторией патогеномики и транскриптомики

Россия, 125315, г. Москва, ул. Балтийская, 8

Виталий Игоревич Логинов

ФГБНУ «Научно-исследовательский институт общей патологии и патофизиологии»

Email: loginov7w@gmail.com
ORCID iD: 0000-0003-2668-8096

канд. биол. наук, вед. науч. сотр. лаборатории патогеномики и транскриптомики

Россия, 125315, г. Москва, ул. Балтийская, 8

Николай Евгеньевич Кушлинский

ФГБУ «Национальный медицинский исследовательский центр онкологии имени Н.Н. Блохина» Минздрава России

Email: biochimia@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0002-3898-4127

д-р мед. наук, профессор, академик РАН, заведующий лабораторией клинической биохимии и лабораторной диагностики

Россия, 115478, г. Москва, Каширское шоссе, 23

Список литературы

Дополнительные файлы