Полиморфизм генов ITGA4, ITGB7, TNFα, IL10 у пациентов с язвенным колитом бурятской этнической группы

Обложка


Цитировать

Полный текст

Аннотация

Актуальность. Проводимые в мире исследования генетического материала, вариантов полиморфизма и  прогностических моделей генов, связанных с  иммуно-ассоциированными заболеваниями, выявили различия в  трансэтнических когортах населения, обусловливающие фенотипические и другие особенности течения таких заболеваний. Язвенный колит (ЯК) представляет собой хроническое иммунное воспаление слизистой оболочки толстой кишки. При ЯК обнаружено более 100 полиморфизмов генов, ассоциированных с  многофакторными интегральными взаимодействиями.

Цель  – изучить полиморфизм генов ITGA4(rs1143674, rs1449263), ITGB7(rs11574532), TNFα(rs1800629), IL10(rs1800871, rs1800896) у больных ЯК – представителей бурятской этнической группы, родившихся и проживающих на территории Иркутской области, Республики Бурятия и Забайкальского края.

Материал и  методы. В  исследование включено 49  человек: пациенты с  ЯК (n=24) и  здоровые добровольцы (n=25), сопоставимые по полу, возрасту и  этнической принадлежности. Материалом для молекулярно-генетического анализа методом полимеразной цепной реакции в режиме реального времени служили образцы ДНК из лейкоцитов цельной крови.

Результаты. Различия распространения генотипов ITGA4(rs1143674, rs1449263), ITGB7(rs11574532), TNFα(rs1800629), IL10(rs1800871) между группами не достигали статистической значимости (р>0,05). У гомозигот IL10(rs1800896) GG шансы развития ЯК были выше по сравнению с  носителями других полиморфных вариантов (отношение шансов (ОШ) 24; 95% доверительный интервал (ДИ) 2,783–206,969; р=0,001). Гомозиготы АА реже встречались среди пациентов по сравнению со здоровым контролем (ОШ 0,17; 95% ДИ 0,049–0,589; р=0,004). Анализ распределения частот генотипов всех исследуемых генов с  учетом клинических особенностей заболевания не показал статистически значимых результатов (р>0,05). По результатам проведенной бинарной логистической регрессии установлено: генотип IL10(rs1800896) GG был предиктором ЯК с  чувствительностью 96% и специфичностью 50% (AUC 0,760; 95% ДИ 0,621–0,899; p=0,002; стандартная ошибка 0,71).

Заключение. Гомозиготный вариант IL10(rs1800896)GG выступает предиктором развития ЯК, а  гомозиготы АА статистически значимо чаще встречаются среди здоровых лиц бурятской когорты. 

Об авторах

И. В. Жилин

ФГБНУ «Иркутский научный центр хирургии и травматологии»;
ФГБОУ ВО «Читинская государственная медицинская академия» Минздрава России

Автор, ответственный за переписку.
Email: zhivoj1113@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0002-2405-0198

Жилин Иван Валерьевич – врач-колопроктолог ФГБНУ «Иркутский научный центр хирургии и травматологии», аспирант ФГБНУ «Иркутский научный центр хирургии и травматологии»

664003, г. Иркутск, ул. Борцов Революции, 1,

672000, г. Чита, ул. Горького, 39а

Россия

Е. Ю. Чашкова

ФГБНУ «Иркутский научный центр хирургии и травматологии»

Email: fake@neicon.ru
ORCID iD: 0000-0002-7953-6523

Чашкова Елена Юрьевна – кандидат медицинских наук, врач-колопроктолог, заведующая лабораторией реконструктивной хирургии научного отдела клинической хирургии,

664003, г. Иркутск, ул. Борцов Революции, 1

Россия

А. А. Жилина

ФГБОУ ВО «Читинская государственная медицинская академия» Минздрава России

Email: fake@neicon.ru
ORCID iD: 0000-0002-4405-2975

Жилина Альбина Александровна – кандидат медицинских наук, врач-гастроэнтеролог, доцент кафедры терапии факультета повышения квалификации и профессиональной переподготовки специалистов,

672000, г. Чита, ул. Горького, 39а

Россия

А. Ч. Цыремпилова

ГАУЗ «Республиканская клиническая больница им. Н.А. Семашко» Минздрава Республики Бурятия

Email: fake@neicon.ru
ORCID iD: 0000-0003-2810-1113

Цыремпилова Арюна Чимитдоржиевна – врач-гастроэнтеролог, заведующая отделением гастроэнтерологии,

670031, г. Улан-Удэ, ул. Павлова, 12

Россия

Список литературы

  1. Язвенный колит: клинические рекомендации [Интернет]. 2020. Доступно на: http://www.consultant.ru/document/cons_doc_LAW_358274/8efd5f17af55cb35a770f73937590c642437b7eb.
  2. Shi W, Zou R, Yang M, Mai L, Ren J, Wen J, Liu Z, Lai R. Analysis of Genes Involved in Ulcerative Colitis Activity and Tumorigenesis Through Systematic Mining of Gene Co-expression Networks. Front Physiol. 2019;10:662. doi: 10.3389/fphys.2019.00662.
  3. Ledergerber M, Lang BM, Heinrich H, Biedermann L, Begré S, Zeitz J, Krupka N, Rickenbacher A, Turina M, Greuter T, Schreiner P, Roth R, Siebenhüner A, Vavricka SR, Rogler G, Beerenwinkel N, Misselwitz B; Swiss IBD Cohort Study Group. Abdominal pain in patients with inflammatory bowel disease: association with single-nucleotide polymorphisms prevalent in irritable bowel syndrome and clinical management. BMC Gastroenterol. 2021;21(1):53. doi: 10.1186/s12876-021-01622-x.
  4. Axelrad JE, Cadwell KH, Colombel JF, Shah SC. The role of gastrointestinal pathogens in inflammatory bowel disease: a systematic review. Therap Adv Gastroenterol. 2021;14:17562848211004493. doi: 10.1177/17562848211004493.
  5. Национальный состав России 2021 (перепись 2010) [Интернет]. Доступно на: http://www.statdata.ru/nacionalnyj-sostav-rossii.
  6. Денисова ГА. Структура генофондов этнических групп Южной и Центральной Сибири. Вестник Северо-Восточного научного центра ДВО РАН. 2009;(3):78–85.
  7. Дедов ИИ, Колесникова ЛИ, Бардымова ТП, Прокофьев СА, Иванова ОН. Клинические, генетические и метаболические особенности сахарного диабета у больных бурятской популяции. Сахарный диабет. 2006;9(3): 2–5. doi: 10.14341/2072-0351-6166.
  8. Киреева ВВ, Орлова ГМ, Верлан НВ, Бессонова ЛО, Лемешко ЕХ. Прогностическая роль факторов риска ишемической болезни сердца в разных этнических группах Прибайкалья. Сибирский медицинский журнал (Иркутск). 2009;90(7):34–36.
  9. Lord JD, Long SA, Shows DM, Thorpe J, Schwedhelm K, Chen J, Kita M, Buckner JH. Circulating integrin alpha4/beta7+ lymphocytes targeted by vedolizumab have a pro-inflammatory phenotype. Clin Immunol. 2018;193:24–32. doi: 10.1016/j.clim.2018.05.006.
  10. Гончарова ИА, Назаренко МС, Бабушкина НП, Марков АВ, Печерина ТБ, Кашталап ВВ, Тарасенко НВ, Понасенко АВ, Барабараш ОЛ, Пузырёв ВП. Генетическая предрасположенность к инфаркту миокарда в разных возрастных группах. Молекулярная биология. 2020;54(2):224– 232. doi: 10.31857/S0026898420020044.
  11. Correia C, Coutinho AM, Almeida J, Lontro R, Lobo C, Miguel TS, Martins M, Gallagher L, Conroy J, Gill M, Oliveira G, Vicente AM. Association of the alpha4 integrin subunit gene (ITGA4) with autism. Am J Med Genet B Neuropsychiatr Genet. 2009;150B(8):1147–1151. doi: 10.1002/ajmg.b.30940.
  12. Ивашкин ВТ, Шелыгин ЮА, Халиф ИЛ., Белоусова ЕА, Шифрин ОС, Абдулганиева ДИ, Абдулхаков РА, Алексеева ОП, Алексеенко СА, Ачкасов СИ, Барановский АЮ, Болихов КВ, Валуйских ЕЮ, Варданян АВ, Веселов АВ, Веселов ВВ., Головенко АО, Головенко ОВ, Григорьев ЕГ, Губонина ИВ, Жигалова ТН, Кашников ВН, Кизова ЕА, Князев ОВ, Костенко НВ, Куляпин АВ, Морозова НА, Муравьев АВ, Низов АА, Никитина НВ, Николаева НН, Никулина НВ, Одинцова АХ, Осипенко МФ, Павленко ВВ, Парфенов АИ, Полуэктова ЕА, Потапов АС, Румянцев ВГ, Светлова ИО, Ситкин СИ, Тимербулатов ВМ, Ткачев АВ, Ткаченко ЕИ, Фролов СА, Хубезов ДА, Чашкова ЕЮ, Шапина МВ, Щукина ОБ, Яковлев АА. Клинические рекомендации Российской гастроэнтерологической ассоциации и Ассоциации колопроктологов России по диагностике и лечению язвенного колита. Колопроктология. 2017;1(59): 6–30.
  13. Lang TA, Altman DG. Basic statistical reporting for articles published in biomedical journals: the "Statistical Analyses and Methods in the Published Literature" or the SAMPL Guidelines. Int J Nurs Stud. 2015;52(1):5–9. doi: 10.1016/j.ijnurstu.2014.09.006.
  14. Мудров ВА. Алгоритмы статистического анализа качественных признаков в биомедицинских исследованиях с помощью пакета программ SPSS. Забайкальский медицинский вестник. 2020;(1):151–163.
  15. Мудров ВА. Алгоритмы регрессионного анализа в биомедицинских исследованиях с помощью пакета программ SPSS. Забайкальский медицинский вестник. 2020;(2): 177–190.
  16. Etzioni A, Harlan J. Adhesion molecules and leukocyte adhesion defects. In: Smith E, Puck J, Ochs H (eds). Primary Immunodeficiency Diseases, a Molecular and Genetic Approach. Oxford: Oxford University Press; 1998. p. 435–452.
  17. van Heel DA, Carey AH, Jewell DP. Identification of novel polymorphisms in the beta7 integrin gene: family-based association studies in inflammatory bowel disease. Genes Immun. 2001;2(8):455–460. doi: 10.1038/sj.gene.6363810.
  18. Жилин ИВ, Чашкова ЕЮ, Жилина АА, Пушкарев БС, Коротаева НС. Роль полиморфизма гена TNFα в положениях 238G/A и 308G/A в этиопатогенезе воспалительных заболеваний кишечника у различных этнических групп. Альманах клинической медицины. 2019;47(6):548–558. doi: 10.18786/2072-0505-2019-47-067.
  19. Quiroz-Cruz S, Posada-Reyes B, Alatorre-García T, Del Real-Calzada CM, GarcíaSamper X, Escobar-Gutiérrez A, VázquezChacón CA, Martínez-Guarneros JA, Cruz-Rivera M, Vaughan G, Fonseca-Coronado S. Genetic polymorphisms present in IL10, IL23R, NOD2, and ATG16L1 associated with susceptibility to inflammatory bowel disease in Mexican population. Eur J Gastroenterol Hepatol. 2020;32(1):10–16. doi: 10.1097/MEG.0000000000001540.
  20. Shiotani A, Kusunoki H, Kimura Y, Ishii M, Imamura H, Tarumi K, Manabe N, Kamada T, Hata J, Haruma K. S100A expression and interleukin-10 polymorphisms are associated with ulcerative colitis and diarrhea predominant irritable bowel syndrome. Dig Dis Sci. 2013;58(8):2314–2323. doi: 10.1007/s10620-013-2677-y.
  21. Ebrahimi Daryani N, Saghazadeh A, Moossavi S, Sadr M, Shahkarami S, Soltani S, Farhadi E, Rezaei N. Interleukin-4 and interleukin-10 gene polymorphisms in patients with inflammatory bowel disease. Immunol Invest. 2017;46(7):714–729. doi: 10.1080/08820139.2017.1360343.

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать

© Жилин И.В., Чашкова Е.Ю., Жилина А.А., Цыремпилова А.Ч., 2021

Creative Commons License
Эта статья доступна по лицензии Creative Commons Attribution 4.0 International License.

Данный сайт использует cookie-файлы

Продолжая использовать наш сайт, вы даете согласие на обработку файлов cookie, которые обеспечивают правильную работу сайта.

О куки-файлах