Конечно-элементный анализ при моделировании структур сердца и аорты
- Авторы: Смирнов А.А.1, Овсепьян А.Л.2, Квиндт П.А.2, Палеев Ф.Н.3,4, Борисова Е.В.5, Яковлев Е.В.1
-
Учреждения:
- ГОУ ВО МО Московский государственный областной университет
- ФГАОУ ВО «Санкт-Петербургский государственный электротехнический университет «ЛЭТИ» им. В.И. Ульянова (Ленина)»
- ГБУЗ МО «Московский областной научноисследовательский клинический институт им. М.Ф. Владимирского»
- ФГБУ «Национальный медицинский исследовательский центр кардиологии» Минздрава России
- ГБУЗ МО «Московский областной научно-исследовательский клинический институт им. М.Ф. Владимирского»
- Выпуск: Том 49, № 6 (2021)
- Страницы: 375-384
- Раздел: ОРИГИНАЛЬНЫЕ СТАТЬИ
- URL: https://almclinmed.ru/jour/article/view/1576
- DOI: https://doi.org/10.18786/2072-0505-2021-49-043
- ID: 1576
Цитировать
Полный текст
Аннотация
Актуальность. Трехмерное моделирование различных анатомических структур стало в последнее время самостоятельным направлением топографо-анатомических и биомеханических исследований. Существующие методы визуализации in vivo и количественного анализа in silico позволяют выполнять точное моделирование этих процессов с целью изучения патогенеза заболеваний сердечно-сосудистой системы, прогнозирования рисков, планирования хирургических вмешательств и виртуальной отработки их отдельных этапов.
Цель – разработка методов создания, анализа и валидации персонализированных моделей различных структур сердца и дуги аорты с учетом их морфологических особенностей.
Материал и методы. В ходе работы были использованы 14 компьютерно-томографических исследований рандомизированных больных, не имеющих аномалий и/или патологии сердца, аортального клапана и луковицы аорты. Анализ и дальнейшие преобразования томограмм осуществляли с помощью программного обеспечения (ПО) Vidar DICOM Viewer, SolidWorks 2016, VMTKLab. Для FSI-моделирования дуги аорты по данным функциональной мультиспиральной компьютерной томографической (МСКТ)-коронарографии (женщина, 55 лет) была создана персонализированная модель восходящего отдела аорты и дуги аорты в момент начала систолы. В ПО HyperMesh (Altair Engineering Inc., США) построена сетка конечных элементов проточной области, адвентиции и медии аорты. Для моделирования механических свойств структур аорты применена анизотропная гиперупругая модель материала Хольцапфеля – Гассера – Огдена. Моделирование материалов, постановку граничных условий и анализ взаимодействия жидкости и структуры (англ. fluid-structure interaction, FSI) проводили в ПО Abaqus CAE 6.14 (Simulia, Johnston, США). При создании конечно-элементного шаблона левого желудочка сердца использовали стратегию адаптивного мешинга изображения, предложенную Янгом. Реализация алгоритма выполнена в среде программной разработки IDE PyCharm на языке Python 3.7. Базисом для реализации алгоритма стали библиотеки с открытым исходным кодом (англ. opensource libraries) OpenCV, NumPy, Matplotlib и SciPy.
Результаты. Первым этапом разработки модели аортального клапана стало построение его виртуального 3D-шаблона, после чего была построена целостная геометрическая модель. Следующим этапом работы над шаблоном было преобразование геометрической модели аортального клапана в параметрическую, что было реализовано путем применения встроенного в SolidWorks инструмента «Уравнения». В ходе работы с моделью каких-либо проблем с геометрией при деформации не выявлено. Для моделирования сегмента аорты были использованы данные функциональной МСКТ-коронарографии. На основе этих данных с применением ПО Inobitec DICOM Viewer генерировалась мультипланарная реконструкция зоны интереса, включающая анатомические структуры сердца и дуги аорты. Из полученного набора контуров была создана трехмерная модель, которая затем конвертировалась в полигональную STL-модель (англ. stereolithography). Разработан алгоритм адаптивного мешинга для создания полигонального деформируемого шаблона, применимого для регистрации как сетчатыми методами (B-Spline), так и на основе особенностей изображения (гомологичные пиксели).
Заключение. Разработанная параметрическая 3D-модель анатомических структур аортального клапана способна адекватно изменять свою геометрию при внешних воздействиях и может быть использована в симуляторах эндоваскулярных кардиохирургических вмешательств.
Ключевые слова
Об авторах
А. А. Смирнов
ГОУ ВО МО Московский государственный областнойуниверситет
Автор, ответственный за переписку.
Email: savmeda@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0002-2661-3759
Смирнов Александр Александрович – кандидат медицинских наук, доцент, исполняющий обязанности заведующего кафедрой фундаментальных медицинских дисциплин
197082, г. Санкт-Петербург, Лыжный пер., 8–1–366,
142400, Московская обл., г. Ногинск, ул. 3-го Интернационала, 117
РоссияА. Л. Овсепьян
ФГАОУ ВО «Санкт-Петербургский государственный электротехнический университет «ЛЭТИ» им. В.И. Ульянова (Ленина)»
Email: fake@neicon.ru
ORCID iD: 0000-0002-4050-214X
Овсепьян Артур Левонович – магистрант кафедры биотехнических систем
197376, г. Санкт-Петербург, ул. Профессора Попова, 5
РоссияП. А. Квиндт
ФГАОУ ВО «Санкт-Петербургский государственный электротехнический университет «ЛЭТИ» им. В.И. Ульянова (Ленина)»
Email: fake@neicon.ru
ORCID iD: 0000-0001-8867-6440
Квиндт Павел Александрович – магистрант кафедры биотехнических систем
197376, г. Санкт-Петербург, ул. Профессора Попова, 5
РоссияФ. Н. Палеев
ГБУЗ МО «Московский областной научноисследовательский клинический институт им. М.Ф. Владимирского»;ФГБУ «Национальный медицинский исследовательский центр кардиологии» Минздрава России
Email: fake@neicon.ru
ORCID iD: 0000-0001-9481-9639
Палеев Филипп Николаевич – доктор медицинских наук, профессор, член-корреспондент РАН, заведующий кафедрой терапии факультета усовершенствования врачей ГБУЗ МО «Московский областной научноисследовательский клинический институт им. М.Ф. Владимирского»; первый заместитель генерального директора, заместитель генерального директора по научной работе ФГБУ «Национальный медицинский исследовательский центр кардиологии» Минздрава России
129110, г. Москва, ул. Щепкина, 61/2,
121552, г. Москва, ул. 3-я Черепковская, 15а
РоссияЕ. В. Борисова
ГБУЗ МО «Московский областной научно-исследовательский клинический институт им. М.Ф. Владимирского»
Email: fake@neicon.ru
Борисова Екатерина Викторовна – доктор медицинских наук, старший научный сотрудник отделения кардиологии
129110, г. Москва, ул. Щепкина, 61/2
РоссияЕ. В. Яковлев
ГОУ ВО МО Московский государственный областнойуниверситет
Email: fake@neicon.ru
ORCID iD: 0000-0002-8435-7562
Яковлев Евгений Васильевич – кандидат медицинских наук, доцент кафедры фундаментальных медицинских дисциплин
142400, Московская обл., г. Ногинск, ул. 3-го Интернационала, 117
РоссияСписок литературы
- Гейдаров НА, Гайнуллова КС, Дрыгина ОС. Компьютерные методы моделирования течения крови в задачах кардиологии и кардиохирургии. Комплексные проблемы сердечно-сосудистых заболеваний. 2018;7(2):129–136. doi: 10.17802/2306-1278-2018-7-2-129-136.
- Bahraseman HG, Languri EM, Yahyapourjalaly N, Espino DM. Fluid-structure interaction modeling of aortic valve stenosis at different heart rates. Acta Bioeng Biomech. 2016;18(3):11–20.
- Mao W, Caballero A, McKay R, Primiano C, Sun W. Fully-coupled fluid-structure interaction simulation of the aortic and mitral valves in a realistic 3D left ventricle model. PLoS One. 2017;12(9):e0184729. doi: 10.1371/journal.pone.0184729.
- Gilmanov A, Barker A, Stolarski H, Sotiropoulos F. Image-guided fluid-structure interaction simulation of transvalvular hemodynamics: Quantifying the effects of varying aortic valve leaflet thickness. Fluids. 2019;4(3):119. doi: 10.3390/fluids4030119.
- Kunzelman KS, Grande KJ, David TE, Cochran RP, Verrier ED. Aortic root and valve relationships. Impact on surgical repair. J Thorac Cardiovasc Surg. 1994;107(1):162–170.
- Шихвердиев НН, Марченко СП. Основы реконструктивной хирургии клапанов сердца. СПб.: Дитон; 2007. 340 с.
- Spühler JH, Jansson J, Jansson N, Hoffman J. 3D Fluid-Structure Interaction Simulation of Aortic Valves Using a Unified Continuum ALE FEM Model. Front Physiol. 2018;9:363. doi: 10.3389/fphys.2018.00363.
- Колсанов АВ, Манукян АА, Зельтер ПМ, Чаплыгин СС, Капишников АВ. Виртуальное моделирование операции на печени на основе данных компьютерной томографии. Анналы хирургической гепатологии. 2016;21(4):16–22. doi: 10.16931/1995-5464.2016416-22.
- Колсанов АВ, Мякотных МН, Миронов АА, Канаев ЕИ. 3D-анатомия конфлюэнса воротной вены по данным компьютерной томографии. Оперативная хирургия и клиническая анатомия (Пироговский научный журнал). 2020;4(1):9–18. doi: 10.17116/operhirurg202040119.
- Колсанов АВ, Зельтер ПМ, Хобта РВ, Чаплыгин СС, Манукян АА. Первые результаты применения интраоперационной навигации на основе данных КТ и МРТ у пациента с опухолью межжелудочковой перегородки. Российский электронный журнал лучевой диагностики. 2020;10(4): 271–276. doi: 10.21569/2222-7415-2020-10-4-271-276.
- Ovsepyan AL, Kvindt PA, Pustozerov EA. Development of the Software Complex for Planning and Simulation of Robot-Assisted Radical Prostatectomy. 2018 Third International Conference on Human Factors in Complex Technical Systems and Environments (ERGO) [Internet]. IEEE. 2018. doi: 10.1109/ERGO.2018.8443860.
- Колсанов АВ, Воронин АС. Программа для отработки алгоритма выполнения хирургических операций «Виртуальный хирург». Свид. о регистрации программы для ЭВМ RU 2019619242 от 15.07.2019.
- Колсанов АВ, Линева ОИ, Иванова ВД. Разработка и внедрение российских симуляционных и виртуальных технологий в современный образовательный процесс. Акушерство и гинекология. 2016;(7):83–87. doi: 10.18565/aig.2016.7.83-87.
- Ovsepian A, Smirnov A, Dydykin S, Vasil'ev Yu, Trunin E, Shatunova O, Aleksandrov A, Ostyakova A, Utkin A. Personalized FSI-modeling of the aortic bulb and arch to predict its mechanical behavior and assess the loads during the cardiac cycle. Archiv Euromedica. 2021;11(2): 13–16. doi: 10.35630/2199-885X/2021/11/2/3.