<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<!DOCTYPE root>
<article xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xmlns:ali="http://www.niso.org/schemas/ali/1.0/" article-type="other" dtd-version="1.2" xml:lang="en"><front><journal-meta><journal-id journal-id-type="publisher-id">Almanac of Clinical Medicine</journal-id><journal-title-group><journal-title xml:lang="en">Almanac of Clinical Medicine</journal-title><trans-title-group xml:lang="ru"><trans-title>Альманах клинической медицины</trans-title></trans-title-group></journal-title-group><issn publication-format="print">2072-0505</issn><issn publication-format="electronic">2587-9294</issn><publisher><publisher-name xml:lang="en">Moscow Regional Research and Clinical Institute (MONIKI)</publisher-name></publisher></journal-meta><article-meta><article-id pub-id-type="publisher-id">934</article-id><article-id pub-id-type="doi">10.18786/2072-0505-201846-8-742-747</article-id><article-categories><subj-group subj-group-type="toc-heading" xml:lang="en"><subject>ARTICLES</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="toc-heading" xml:lang="ru"><subject>ОРИГИНАЛЬНЫЕ СТАТЬИ</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="article-type"><subject></subject></subj-group></article-categories><title-group><article-title xml:lang="en">Evaluation of nonlinear dynamics of the cell structure damage as a promising method for personalized cancer diagnostics</article-title><trans-title-group xml:lang="ru"><trans-title>Оценка нелинейной динамики поврежденности клеточных структур как перспективный метод персонализированной онкодиагностики</trans-title></trans-title-group></title-group><contrib-group><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Naimark</surname><given-names>O. B.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Наймарк</surname><given-names>О. Б.</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p><bold>Oleg B. Naimark – </bold>ScD in Phys.-Math., Professor, Head of Laboratory of Physical Foundation of Strength</p><p><italic>1 Akademika Koroleva ul., Perm, 614013</italic></p></bio><bio xml:lang="ru"><p><bold>Наймарк Олег Борисович – </bold>доктор физико-математических наук, профессор, заведующий лабораторией физических основ прочности</p><p><italic>614013, г. Пермь, ул. Академика Королева, 1</italic></p></bio><email>naimark@icmm.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff1"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Nikityuk</surname><given-names>A. S.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Никитюк</surname><given-names>А. С.</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p><bold>Aleksandr S. Nikityuk – </bold>Junior Research Fellow, Laboratory of Physical Foundation of Strength </p><p><italic>1 Akademika Koroleva ul., Perm, 614013</italic></p></bio><bio xml:lang="ru"><p><bold>Никитюк Александр Сергеевич – </bold>младший научный сотрудник лаборатории физических основ прочности </p><p><italic>614013, г. Пермь, ул. Академика Королева, 1</italic></p></bio><xref ref-type="aff" rid="aff1"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Nebogatikov</surname><given-names>V. O.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Небогатиков</surname><given-names>В. О.</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p><bold>Vladimir O. Nebogatikov – </bold>PhD in Biology, Junior Research Fellow, Laboratory of Biological Active Compounds </p><p><italic>3 Akademika Koroleva ul., Perm, 614013</italic></p></bio><bio xml:lang="ru"><p><bold>Небогатиков Владимир Олегович – </bold>кандидат биологических наук, младший научный сотрудник лаборатории биологически активных соединений </p><p><italic>614013, г. Пермь, ул. Академика Королева, 3</italic></p></bio><xref ref-type="aff" rid="aff2"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Grishko</surname><given-names>V. V.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Гришко</surname><given-names>В. В.</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p><bold>Viktoriya V. Grishko – </bold>PhD in Chemistry, Associate Professor, Head of Laboratory of Biological Active Compounds</p><p><italic>3 Akademika Koroleva ul., Perm, 614013</italic></p></bio><bio xml:lang="ru"><p><bold>Гришко Виктория Викторовна – </bold>кандидат химических наук, доцент, заведующая лабораторией биологически активных соединений </p><p><italic>614013, г. Пермь, ул. Академика Королева, 3</italic></p></bio><xref ref-type="aff" rid="aff2"/></contrib></contrib-group><aff-alternatives id="aff1"><aff><institution xml:lang="en">Institute of Continuous Media Mechanics of the Ural Branch of the Russian Academy of Sciences</institution></aff><aff><institution xml:lang="ru">«Институт механики сплошных сред Уральского отделения Российской академии наук» – филиал ФГБУН «Пермский федеральный исследовательский центр Уральского отделения Российской академии наук»</institution></aff></aff-alternatives><aff-alternatives id="aff2"><aff><institution xml:lang="en">Institute of Technical Chemistry of the Ural Branch of the Russian Academy of Sciences</institution></aff><aff><institution xml:lang="ru">«Институт технической химии Уральского отделения Российской академии наук» – филиал ФГБУН «Пермский федеральный исследовательский центр Уральского отделения Российской академии наук»</institution></aff></aff-alternatives><pub-date date-type="pub" iso-8601-date="2018-12-31" publication-format="electronic"><day>31</day><month>12</month><year>2018</year></pub-date><volume>46</volume><issue>8</issue><issue-title xml:lang="en"/><issue-title xml:lang="ru"/><fpage>742</fpage><lpage>747</lpage><history><date date-type="received" iso-8601-date="2018-12-30"><day>30</day><month>12</month><year>2018</year></date></history><permissions><copyright-statement xml:lang="en">Copyright ©; 2018, Naimark O.B., Nikityuk A.S., Nebogatikov V.O., Grishko V.V.</copyright-statement><copyright-statement xml:lang="ru">Copyright ©; 2018, Наймарк О.Б., Никитюк А.С., Небогатиков В.О., Гришко В.В.</copyright-statement><copyright-year>2018</copyright-year><copyright-holder xml:lang="en">Naimark O.B., Nikityuk A.S., Nebogatikov V.O., Grishko V.V.</copyright-holder><copyright-holder xml:lang="ru">Наймарк О.Б., Никитюк А.С., Небогатиков В.О., Гришко В.В.</copyright-holder><ali:free_to_read xmlns:ali="http://www.niso.org/schemas/ali/1.0/"/><license><ali:license_ref xmlns:ali="http://www.niso.org/schemas/ali/1.0/">https://creativecommons.org/licenses/by/4.0</ali:license_ref></license></permissions><self-uri xlink:href="https://almclinmed.ru/jour/article/view/934">https://almclinmed.ru/jour/article/view/934</self-uri><abstract xml:lang="en"><p><bold>Background: </bold>Modulation interference microscopy is one of the promising technologies for early personalized cancer diagnostics, while it gives the possibility to obtain real-time images of living functioning cells at a nanometer resolution, as well as to assess spatio-temporal changes of their intracellular structures.</p><p><bold>Aim: </bold>To identify the markers of malignant transformation of cells based on a multiple scale spatio-temporal of the data obtained by lase interferometry during <italic>in situ </italic>registration of changes in intracellular structures.</p><p><bold>Materials and methods: </bold>The study was performed with the breast adenocarcinoma MCF-7 cell line and human kidney epithelial cells HEK 293 provided by the N.N. Blokhin National Medical Research Centre of Oncology (Moscow, Russia). Changes in fluctuation of the living cell phase thickness were measured with a laser modulation interference microscope MIM-340 (PA UOMZ, Russia). The multifractal detrended fluctuation analysis (MF-DFA) was used to assess the results obtained.</p><p><bold>Results: </bold>By comparison of the scaling exponential spectra and corresponding spectra of the singular fluctuations in the minimal and maximal diameters of the phase pictures of HEK 293 cells and MCF-7 cells, it was shown that the cancer cell dynamics has definite monofractal properties: a linear dependency of the scaling exponents <italic>τ</italic><italic> </italic>from the actual <italic>q </italic>parameter and “dotted” singularity spectrum (the spectral width does not exceed 0.1). The dynamics of healthy cell demonstrated multifractal properties, such as a non-linear dependency <italic>τ</italic><italic>(q) </italic>and a bell shaped singularity spectrum (the spectral width over 0.1).</p><p><bold>Conclusion: </bold>We have proposed a new approach to assess the intracellular structural damage during oncogenesis. The signs of monofractality are objective criteria of malignization. The results obtained seems promising as early diagnostic markers of cancer transformation (damage) of cells and determination of tumor cell sensitivity / resistance to anti-tumor agents in an individual patient.</p></abstract><trans-abstract xml:lang="ru"><p><bold>Актуальность. </bold>Модуляционная интерференционная микроскопия – одна из перспективных технологий для проведения ранней персонализированной диагностики онкологических заболеваний, поскольку позволяет в режиме реального времени получать изображение живых функционирующих клеток с нанометровым разрешением, а также проводить оценку пространственно-временной динамики их субклеточных структур.</p><p><bold>Цель – </bold>выявить маркеры злокачественной трансформации клеток на основе многомасштабного пространственно-временного анализа данных лазерной интерферометрии <italic>in situ </italic>регистрации динамики субклеточных структур.</p><p><bold>Материал и методы. </bold>Материалом служили клеточные линии аденокарциномы молочной железы MCF-7 и эпителиальных клеток почки человека HEK 293, предоставленные ФГБУ «Национальный медицинский исследовательский центр онкологии им. Н.Н. Блохина» Минздрава России (Москва). Измерения динамики флуктуаций фазовой толщины живых клеток проводили с помощью лазерного модуляционного интерференционного микроскопа MIM-340 (АО «ПО «УОМЗ», Россия). Для оценки полученных данных использовали алгоритм мультифрактального анализа флуктуаций с исключенным трендом (MF-DFA).</p><p><bold>Результаты. </bold>При сравнении спектров скейлинговых экспонент и соответствующих им спектров сингулярностей флуктуаций минимального и максимального диаметров фазовых изображений эпителиальных клеток почки культуры HEK 293 и клеток аденокарциномы молочной железы культуры MCF-7 установлено, что динамика раковых клеток обладает ярко выраженными свойствами монофрактала: линейная зависимость скейлинговых экспонент <italic>τ </italic>от действительного параметра <italic>q </italic>и «точечный» спектр сингулярностей (ширина спектра не превышает значения 0,1). Динамика нормальных клеток демонстрирует мультифрактальные свойства: нелинейная зависимость <italic>τ(q) </italic>и колоколообразный спектр сингулярностей (ширина спектра больше значения 0,1).</p><p><bold>Заключение. </bold>Предложен новый подход к оценке поврежденности субклеточных структур в процессе онкогенеза на основе анализа динамики флуктуаций фазовой толщины живых клеток в реальном времени. Объективными критериями злокачественного перерождения являются признаки монофрактальности. Полученные результаты в дальнейшем могут оказаться перспективными в качестве ранних диагностических маркеров злокачественной трансформации (повреждения) клеток и определения чувствительности/устойчивости клеток опухоли конкретного пациента к противоопухолевым препаратам.</p></trans-abstract><kwd-group xml:lang="en"><kwd>laser interference microscopy</kwd><kwd>MCF-7 breast adenocarcinoma cells</kwd><kwd>human kidney epithelial cells HEK 293</kwd><kwd>spatio-temporal invariants</kwd><kwd>cancer cell damage</kwd></kwd-group><kwd-group xml:lang="ru"><kwd>лазерная интерференционная микроскопия</kwd><kwd>клетки аденокарциномы молочной железы MCF-7</kwd><kwd>эпителиальные клетки почки человека HEK 293</kwd><kwd>пространственно-временные инварианты</kwd><kwd>поврежденность раковых клеток</kwd></kwd-group><funding-group/></article-meta></front><body></body><back><ref-list><ref id="B1"><label>1.</label><mixed-citation>1. Тычинский ВП. Динамическая фазовая микроскопия: возможен ли «диалог» с клеткой? Успехи физических наук. 2007;177(5): 535–52. doi: 10.3367/UFNr.0177.200705c.0535.</mixed-citation></ref><ref id="B2"><label>2.</label><mixed-citation>2. Василенко ИА, Кардашова ЗЗ, Тычинский ВП, Вишенская ТВ, Лифенко РА, Валов АЛ, Иванюта ИВ, Агаджанян БЯ. Клеточная диагностика: возможности витальной компьютерной микроскопии. Вестник последипломного медицинского образования. 2009;(3–4):64–8.</mixed-citation></ref><ref id="B3"><label>3.</label><mixed-citation>3. Majeed H, Sridharan S, Mir M, Ma L, Min E, Jung W, Popescu G. Quantitative phase imaging for medical diagnosis. J Biophotonics. 2017;10(2):177–205. doi: 10.1002/jbio.201600113.</mixed-citation></ref><ref id="B4"><label>4.</label><mixed-citation>4. Bishitz Y, Gabai H, Girshovitz P, Shaked NT. Optical-mechanical signatures of cancer cells based on ﬂuctuation profles measured by interferometry. J Biophotonics. 2014;7(8):624– 30. doi: 10.1002/jbio.201300019.</mixed-citation></ref><ref id="B5"><label>5.</label><mixed-citation>5. Игнатьев ПС, Индукаев КВ, Осипов ПА, Сергеев ИК. Лазерная интерференционная микроскопия для нанобиотехнологий. Медицинская техника. 2013;(1):27–30.</mixed-citation></ref><ref id="B6"><label>6.</label><mixed-citation>6. Naimark O. Nonlinear dynamics and damage induced properties of soft matter with application in oncology. AIP Conference Proceedings. 2017;1882(1):020052. doi: 10.1063/1.5001631.</mixed-citation></ref><ref id="B7"><label>7.</label><mixed-citation>7. Gerasimova-Chechkina E, Toner B, Marin Z, Audit B, Roux SG, Argoul F, Khalil A, Gileva O, Naimark O, Arneodo A. Comparative Multifractal Analysis of Dynamic Infrared Thermograms and X-Ray Mammograms Enlightens Changes in the Environment of Malignant Tumors. Front Physiol. 2016;7:336. doi: 10.3389/fphys.2016.00336.</mixed-citation></ref><ref id="B8"><label>8.</label><mixed-citation>8. Naimark OB, Nikitiuk AS, Baudement MO, Forne T, Lesne A. The physics of cancer: The role of epigenetics and chromosome conformation in cancer progression. AIP Conference Proceedings. 2016;1760(1):020051. doi: 10.1063/1.4960270.</mixed-citation></ref><ref id="B9"><label>9.</label><mixed-citation>9. Tsuchiya M, Selvarajoo K, Piras V, Tomita M, Giuliani A. Local and global responses in complex gene regulation networks. Physica A: Statistical Mechanics and its Applications. 2009;388(8):1738–46. doi: 10.1016/j.physa.2008.12.030.</mixed-citation></ref><ref id="B10"><label>10.</label><mixed-citation>10. Чиссов ВИ, Тычинский ВП, Волченко НН, Решетов ИВ, Кретушев АВ, Вышенская ТВ, Славнова ЕН, Барыгина ВВ, Клемешов ИВ. Когерентная фазовая микроскопия опухолей на модели рака молочной железы. Российский онкологический журнал. 2006;(2):11–5.</mixed-citation></ref><ref id="B11"><label>11.</label><mixed-citation>11. Naimark OB. Defect induced transitions as mechanisms of plasticity and failure in multifeld continua (review paper). In: Capriz G, Mariano P, editors. Advances in multifeld theories of continua with substructure. Boston: Birkhauser; 2004. p. 75–114.</mixed-citation></ref></ref-list></back></article>
