<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<!DOCTYPE root>
<article xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xmlns:ali="http://www.niso.org/schemas/ali/1.0/" article-type="other" dtd-version="1.2" xml:lang="en"><front><journal-meta><journal-id journal-id-type="publisher-id">Almanac of Clinical Medicine</journal-id><journal-title-group><journal-title xml:lang="en">Almanac of Clinical Medicine</journal-title><trans-title-group xml:lang="ru"><trans-title>Альманах клинической медицины</trans-title></trans-title-group></journal-title-group><issn publication-format="print">2072-0505</issn><issn publication-format="electronic">2587-9294</issn><publisher><publisher-name xml:lang="en">Moscow Regional Research and Clinical Institute (MONIKI)</publisher-name></publisher></journal-meta><article-meta><article-id pub-id-type="publisher-id">468</article-id><article-id pub-id-type="doi">10.18786/2072-0505-2017-45-1-2-7</article-id><article-categories><subj-group subj-group-type="toc-heading" xml:lang="en"><subject>ARTICLES</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="toc-heading" xml:lang="ru"><subject>ОРИГИНАЛЬНЫЕ СТАТЬИ</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="article-type"><subject></subject></subj-group></article-categories><title-group><article-title xml:lang="en">The etiology of viral respiratory infections in infants with community-acquired pneumonia</article-title><trans-title-group xml:lang="ru"><trans-title>Этиологическая структура респираторных вирусных инфекций у детей первого года жизни с внебольничными пневмониями</trans-title></trans-title-group></title-group><contrib-group><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Bogdanova</surname><given-names>A. V.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Богданова</surname><given-names>А. В.</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>MD, Postgraduate Student, Chair of Infectious Diseases,</p><p>51 Troitskiy prospekt, Arkhangel'sk, 163000</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>аспирант кафедры инфекционных болезней,</p><p>163000, г. Архангельск, проспект Троицкий, 51</p></bio><email>alessandra.bogdanova@yandex.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff1"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Samodova</surname><given-names>O. V.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Самодова</surname><given-names>О. В.</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>MD, PhD, Head of the Chair of Infectious Diseases,</p><p>51 Troitskiy prospekt, Arkhangel'sk, 163000</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>д-р мед. наук, заведующая кафедрой инфекционных болезней,</p><p>163000, г. Архангельск, проспект Троицкий, 51</p></bio><xref ref-type="aff" rid="aff1"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Bugaeva</surname><given-names>O. S.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Бугаева</surname><given-names>О. С.</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>Resident, Chair of Infectious Diseases,</p><p>51 Troitskiy prospekt, Arkhangel'sk, 163000</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>клинический ординатор кафедры инфекционных болезней,</p><p>163000, г. Архангельск, проспект Троицкий, 51</p></bio><xref ref-type="aff" rid="aff1"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Turabova</surname><given-names>A. L.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Турабова</surname><given-names>А. Л.</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>MD, Head of the Department of Clinical Laboratory Diagnostics,</p><p>7 Obvodnyy kanal prospekt, Arkhangel'sk, 163002</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>заведующая отделением клинической лабораторной диагностики,</p><p>163002, г. Архангельск, проспект Обводный канал, 7</p></bio><xref ref-type="aff" rid="aff2"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Pyatlina</surname><given-names>T. V.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Пятлина</surname><given-names>Т. В.</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>MD, Physician, Department of Clinical Laboratory Diagnostics,</p><p>7 Obvodnyy kanal prospekt, Arkhangel'sk, 163002</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>врач отделения клинической лабораторной диагностики,</p><p>163002, г. Архангельск, проспект Обводный канал, 7</p></bio><xref ref-type="aff" rid="aff2"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Konyukhov</surname><given-names>A. Yu.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Конюхов</surname><given-names>А. Ю.</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>MD, Physician, Department of Infectious Diseases,</p><p>7 Obvodnyy kanal prospekt, Arkhangel'sk, 163002</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>врач инфекционного отделения,</p><p>163002, г. Архангельск, проспект Обводный канал, 7</p></bio><xref ref-type="aff" rid="aff2"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Volkova</surname><given-names>I. I.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Волкова</surname><given-names>И. И.</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>MD, Head of the Department of Infectious Diseases,</p><p>7 Obvodnyy kanal prospekt, Arkhangel'sk, 163002</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>заведующая инфекционным отделением,</p><p>163002, г. Архангельск, проспект Обводный канал, 7</p></bio><xref ref-type="aff" rid="aff2"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Danilogorskaya</surname><given-names>E. V.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Данилогорская</surname><given-names>Е. В.</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>MD, Physician, Department of Infectious Diseases,</p><p>7 Obvodnyy kanal prospekt, Arkhangel'sk, 163002</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>врач инфекционного отделения,</p><p>163002, г. Архангельск, проспект Обводный канал, 7</p></bio><xref ref-type="aff" rid="aff2"/></contrib></contrib-group><aff-alternatives id="aff1"><aff><institution xml:lang="en">Northern State Medical University</institution></aff><aff><institution xml:lang="ru">ФГБОУ ВО Северный государственный медицинский университет Минздрава России</institution></aff></aff-alternatives><aff-alternatives id="aff2"><aff><institution xml:lang="en">Arkhangel'sk Regional Children's Clinical Hospital</institution></aff><aff><institution xml:lang="ru">ГБУЗ АО «Архангельская областная детская клиническая больница имени П.Г. Выжлецова»</institution></aff></aff-alternatives><pub-date date-type="pub" iso-8601-date="2017-01-10" publication-format="electronic"><day>10</day><month>01</month><year>2017</year></pub-date><volume>45</volume><issue>1</issue><issue-title xml:lang="en"/><issue-title xml:lang="ru"/><fpage>2</fpage><lpage>7</lpage><history><date date-type="received" iso-8601-date="2017-02-18"><day>18</day><month>02</month><year>2017</year></date><date date-type="accepted" iso-8601-date="2017-02-18"><day>18</day><month>02</month><year>2017</year></date></history><permissions><copyright-statement xml:lang="en">Copyright ©; 2017, Bogdanova A.V., Samodova O.V., Bugaeva O.S., Turabova A.L., Pyatlina T.V., Konyukhov A.Y., Volkova I.I., Danilogorskaya E.V.</copyright-statement><copyright-statement xml:lang="ru">Copyright ©; 2017, Богданова А.В., Самодова О.В., Бугаева О.С., Турабова А.Л., Пятлина Т.В., Конюхов А.Ю., Волкова И.И., Данилогорская Е.В.</copyright-statement><copyright-year>2017</copyright-year><copyright-holder xml:lang="en">Bogdanova A.V., Samodova O.V., Bugaeva O.S., Turabova A.L., Pyatlina T.V., Konyukhov A.Y., Volkova I.I., Danilogorskaya E.V.</copyright-holder><copyright-holder xml:lang="ru">Богданова А.В., Самодова О.В., Бугаева О.С., Турабова А.Л., Пятлина Т.В., Конюхов А.Ю., Волкова И.И., Данилогорская Е.В.</copyright-holder><ali:free_to_read xmlns:ali="http://www.niso.org/schemas/ali/1.0/"/><license><ali:license_ref xmlns:ali="http://www.niso.org/schemas/ali/1.0/">https://creativecommons.org/licenses/by/4.0</ali:license_ref></license></permissions><self-uri xlink:href="https://almclinmed.ru/jour/article/view/468">https://almclinmed.ru/jour/article/view/468</self-uri><abstract xml:lang="en"><p><bold>Background:</bold> Community-acquired pneumonia can be caused by both bacterial and viral pathogens. The differential diagnosis based only on clinical data is not always feasible. The use of C-reactive protein (CRP) and procalcitonin might give some additional information for treatment decision-making.</p><p><bold>Aim:</bold> To evaluate the structure and rates of viral isolation in community-acquired pneumonia in hospitalized infants and changes in CRP and procalcitonin levels.</p><p><bold>Materials and methods:</bold> Seventy five infants at the age of up to 11 months and 29 days, who were hospitalized with community-acquired pneumonia confirmed by chest X-ray from March 2015 till February 2016, were included into the study. CRP and procalcitonin levels were measured. Detection of viruses in nasopharyngeal swabs was performed by a  real-time polymerase chain reaction.</p><p><bold>Results: </bold>Nucleic acids of respiratory viruses were isolated in 72% (54/75) of infants. The most common were respiratory syncytial virus (in 70.4%, 38/54) and human rhinovirus (in 16.6%, 9/54). Median of white blood cell count in pneumonia associated with respiratory viruses was 10.95 (9; 14.1)×10<sup>9</sup>/L, CRP level, 1.95 (0.5; 7) mg/L, procalcitonin level, 0.087 (0.067; 0.17) ng/mL.</p><p><bold>Conclusion:</bold> The study showed a high prevalence of respiratory viruses in community-acquired pneumonia in infants. There was no increase in CRP and procalcitonin levels in pneumonia associated with respiratory viruses.</p></abstract><trans-abstract xml:lang="ru"><p><bold>Актуальность.</bold> В качестве этиологических факторов внебольничной пневмонии могут выступать как бактериальные патогены, так и вирусные. Дифференциальный диагноз на основании только клинических данных не всегда возможен. Определение С-реактивного белка (CРБ) и  прокальцитонина может дать дополнительную информацию, позволяющую выбрать терапевтическую тактику.</p><p><bold>Цель –</bold> оценить структуру и  частоту выделения вирусных патогенов при внебольничной пневмонии и  изменения CРБ и  прокальцитонина у  госпитализированных детей первого года жизни.</p><p><bold>Материал и  методы.</bold> В  исследование были включены 75  детей в  возрасте до 11  месяцев 29  дней, госпитализированные в  стационар с  рентгенологически подтвержденной внебольничной пневмонией в  период с  марта 2015  по февраль 2016  г. Определяли СРБ, прокальцитонин. Детекцию респираторных вирусов в  мазках из носоглотки выполняли методом полимеразной цепной реакции в  реальном времени.</p><p><bold>Результаты.</bold> Нуклеиновые кислоты респираторных вирусов выявлены у 72% (54 из 75) детей. Наиболее частыми патогенами были респираторно-синцитиальный вирус – 70,4% (38 из 54) и риновирус – 16,6% (9 из 54). Медиана уровня лейкоцитов при пневмонии, ассоциированной с  респираторными вирусами, составила 10,95 (9; 14,1)×10<sup>9</sup>/л; CРБ – 1,95 (0,5; 7) мг/л; прокальцитонина – 0,087 (0,067; 0,17) нг/мл.</p><p><bold>Заключение.</bold> Исследование показало высокую частоту обнаружения респираторных вирусов при внебольничной пневмонии у  детей первого года жизни. При пневмонии, ассоциированной с респираторными вирусами, СРБ и  прокальцитонин не повышались.</p></trans-abstract><kwd-group xml:lang="en"><kwd>infants</kwd><kwd>community-acquired pneumonia</kwd><kwd>respiratory viruses</kwd><kwd>C-reactive protein</kwd><kwd>procalcitonin</kwd></kwd-group><kwd-group xml:lang="ru"><kwd>дети</kwd><kwd>внебольничная пневмония</kwd><kwd>респираторные вирусы</kwd><kwd>С-реактивный белок</kwd><kwd>прокальцитонин</kwd></kwd-group><funding-group/></article-meta></front><body></body><back><ref-list><ref id="B1"><label>1.</label><mixed-citation>1.Jain S, Williams DJ, Arnold SR, Ampofo K, Bramley AM, Reed C, Stockmann C, Anderson EJ, Grijalva CG, Self WH, Zhu Y, Patel A, Hymas W, Chappell JD, Kaufman RA, Kan JH, Dansie D, Lenny N, Hillyard DR, Haynes LM, Levine M, Lindstrom S, Winchell  JM, Katz  JM, Erdman  D, Schneider  E, Hicks LA, Wunderink RG, Edwards KM, Pavia AT, McCullers  JA, Finelli  L; CDC EPIC Study Team. Community-acquired pneumonia requiring hospitalization among U.S. children. N Engl J  Med. 2015;372(9):835–45. doi: 10.1056/NEJMoa1405870.</mixed-citation></ref><ref id="B2"><label>2.</label><mixed-citation>2. Virkki  R, Juven  T, Rikalainen  H, Svedström  E, Mertsola  J, Ruuskanen  O. Differentiation of bacterial and viral pneumonia in children. Thorax. 2002;57(5):438–41. doi: http://dx.doi.org/10.1136/thorax.57.5.438.</mixed-citation></ref><ref id="B3"><label>3.</label><mixed-citation>3. Ruuskanen O, Lahti E, Jennings LC, Murdoch DR. Viral pneumonia. Lancet. 2011;377(9773):1264–75. doi: 10.1016/S0140-6736(10)61459-6.</mixed-citation></ref><ref id="B4"><label>4.</label><mixed-citation>4. Rohde GU. The role of viruses in CAP. In: Chalmers J, Pletz  M, Aliberti  S, editors. European respiratory monograph 63: Community-acquired pneumonia. Norwich: Page Bros Ltd; 2014. p. 74–87.</mixed-citation></ref><ref id="B5"><label>5.</label><mixed-citation>5. Wang M, Cai F, Wu X, Wu T, Su X, Shi Y. Incidence of viral infection detected by PCR and real-time PCR in childhood community-acquired pneumonia: a meta-analysis. Respirology. 2015;20(3): 405–12. doi: 10.1111/resp.12472.</mixed-citation></ref><ref id="B6"><label>6.</label><mixed-citation>6. Figueiredo  LT. Viral pneumonia: epidemiological, clinical, pathophysiological and therapeutic aspects. J  Bras Pneumol. 2009;35(9): 899–906. doi: http://dx.doi.org/10.1590/S1806-37132009000900012.</mixed-citation></ref><ref id="B7"><label>7.</label><mixed-citation>7. Кожевникова  ЕН, Горелов  АВ. Клинико-эпидемиологические особенности и  лечение РС-вирусной инфекции у детей. Инфекционные болезни. 2007;(4):15–21.</mixed-citation></ref><ref id="B8"><label>8.</label><mixed-citation>8.Патрушева  ЮС,  Бакарадзе  МД. Этиологическая структура и  факторы риска развития острых респираторных вирусных инфекций с  поражением нижних дыхательных путей у  детей раннего возраста. Вопросы диагностики в педиатрии. 2012;4(3):45–51.</mixed-citation></ref><ref id="B9"><label>9.</label><mixed-citation>9. Ровный ВБ, Лобзин ЮВ, Бабаченко ИВ, Ибрагимова  ОМ, Романова  ЕС.  Клинико-эпидемиологические особенности респираторно-синцитиальной инфекции у детей разного возраста. Журнал инфектологии. 2013;5(2): 76–81. doi: 10.22625/2072-6732-2013-5-2-76-81.</mixed-citation></ref><ref id="B10"><label>10.</label><mixed-citation>10.Львов НИ, Писарева ММ, Мальцев ОВ, Бузицкая ЖВ, Афанасьева ВС, Михайлова МА, Го А, Янина  МА, Резниченко  НА, Грудинин  МП, Жданов  КВ, Лобзин  ЮВ. Особенности этиологической структуры ОРВИ в  отдельных возрастных и  профессиональных группах населения Санкт-Петербурга в  эпидемический сезон 2013–2014 гг. Журнал инфектологии. 2014;6(3):62–70. doi: 10.22625/2072-6732-2014-6-3-62-70.</mixed-citation></ref><ref id="B11"><label>11.</label><mixed-citation>11.Nicholson  JF, Pesce  MA. Reference ranges for laboratory test and procedures. In: Nelson text book of pediatrics. 17th edition. Philadelphia: Saunder's Elsievier Publishers; 2004. p. 2399.</mixed-citation></ref><ref id="B12"><label>12.</label><mixed-citation>12.Алексеева  ЛА, Ибрагимова  ОМ, Бабаченко  ИВ, Бессонова  ТВ, Головачева  НН. Значение гематологических показателей при острых респираторных вирусных инфекциях у  детей. Журнал инфектологии. 2013;5(3): 43–9. doi: 10.22625/2072-6732-2013-5-3-43-49.</mixed-citation></ref><ref id="B13"><label>13.</label><mixed-citation>13. Esposito S, Daleno C, Prunotto G, Scala A, Tagliabue C, Borzani I, Fossali E, Pelucchi C, Principi N. Impact of viral infections in children with community-acquired pneumonia: results of a study of 17 respiratory viruses. Influenza Other Respir Viruses. 2013;7(1):18–26. doi: 10.1111/j.1750-2659.2012.00340.x.</mixed-citation></ref></ref-list></back></article>
