<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<!DOCTYPE root>
<article xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xmlns:ali="http://www.niso.org/schemas/ali/1.0/" article-type="research-article" dtd-version="1.2" xml:lang="en"><front><journal-meta><journal-id journal-id-type="publisher-id">Almanac of Clinical Medicine</journal-id><journal-title-group><journal-title xml:lang="en">Almanac of Clinical Medicine</journal-title><trans-title-group xml:lang="ru"><trans-title>Альманах клинической медицины</trans-title></trans-title-group></journal-title-group><issn publication-format="print">2072-0505</issn><issn publication-format="electronic">2587-9294</issn><publisher><publisher-name xml:lang="en">Moscow Regional Research and Clinical Institute (MONIKI)</publisher-name></publisher></journal-meta><article-meta><article-id pub-id-type="publisher-id">17393</article-id><article-id pub-id-type="doi">10.18786/2072-0505-2025-53-019</article-id><article-categories><subj-group subj-group-type="toc-heading" xml:lang="en"><subject>POINT OF VIEW</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="toc-heading" xml:lang="ru"><subject>ТОЧКА ЗРЕНИЯ</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="article-type"><subject>Research Article</subject></subj-group></article-categories><title-group><article-title xml:lang="en">Diagnostics of pathogenic <italic>Helicobacter pylori</italic> strains: is this a potential solution for ungrounded eradication therapy?</article-title><trans-title-group xml:lang="ru"><trans-title>Диагностика патогенных штаммов <italic>Helicobacter pylori</italic> – возможное решение проблемы необоснованного назначения эрадикационной терапии?</trans-title></trans-title-group></title-group><contrib-group><contrib contrib-type="author"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0002-7021-6232</contrib-id><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Bogacheva</surname><given-names>Natalia V.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Богачева</surname><given-names>Наталья Викторовна</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>MD, PhD, Associate Professor, Professor of the Department of Microbiology and Virology</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>д-р мед. наук, доцент, профессор кафедры микробиологии и вирусологии</p></bio><email>bogacheva70@mail.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff1"/></contrib><contrib contrib-type="author"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0001-6147-3555</contrib-id><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Kolevatykh</surname><given-names>Ekaterina P.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Колеватых</surname><given-names>Екатерина Петровна</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>MD, PhD, Associate Professor, Head of the Department of Microbiology and Virology</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>канд. мед. наук, доцент, зав. кафедрой микробиологии и вирусологии</p></bio><email>hibica@mail.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff1"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Korneeva</surname><given-names>Elizaveta E.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Корнеева</surname><given-names>Елизавета Евгеньевна</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>student</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>студент</p></bio><email>korneevaliza222@yandex.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff1"/></contrib></contrib-group><aff-alternatives id="aff1"><aff><institution xml:lang="en">Kirov State Medical University</institution></aff><aff><institution xml:lang="ru">ФГБОУ ВО «Кировский государственный медицинский университет» Минздрава России</institution></aff></aff-alternatives><pub-date date-type="pub" iso-8601-date="2025-11-26" publication-format="electronic"><day>26</day><month>11</month><year>2025</year></pub-date><volume>53</volume><issue>4</issue><issue-title xml:lang="ru"/><fpage>206</fpage><lpage>216</lpage><history><date date-type="received" iso-8601-date="2024-12-22"><day>22</day><month>12</month><year>2024</year></date><date date-type="accepted" iso-8601-date="2025-11-11"><day>11</day><month>11</month><year>2025</year></date></history><permissions><copyright-statement xml:lang="en">Copyright ©; 2025, Bogacheva N.V., Kolevatykh E.P., Korneeva E.E.</copyright-statement><copyright-statement xml:lang="ru">Copyright ©; 2025, Богачева Н.В., Колеватых Е.П., Корнеева Е.Е.</copyright-statement><copyright-year>2025</copyright-year><copyright-holder xml:lang="en">Bogacheva N.V., Kolevatykh E.P., Korneeva E.E.</copyright-holder><copyright-holder xml:lang="ru">Богачева Н.В., Колеватых Е.П., Корнеева Е.Е.</copyright-holder><ali:free_to_read xmlns:ali="http://www.niso.org/schemas/ali/1.0/"/><license><ali:license_ref xmlns:ali="http://www.niso.org/schemas/ali/1.0/">https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0</ali:license_ref></license></permissions><self-uri xlink:href="https://almclinmed.ru/jour/article/view/17393">https://almclinmed.ru/jour/article/view/17393</self-uri><abstract xml:lang="en"><p>According to the provisions of Maastricht VI Consensus, the “test and treat” strategy is preferable and eradication therapy for <italic>Helicobacter pylori </italic>is recommended to patients with dyspepsia syndrome. However, some genotype specifics of the pathogen related to its ability to impact the development of <italic>H. pylori</italic>-associated disorders, increased resistance to antibiotics, and negative consequences of the multicomponent treatment of patients with helicobacteriosis make it necessary to review the unequivocal benefits of mandatory eradication strategy. The aim of this review is to analyze the diagnostic potential of identification of pathogenic <italic>H. рylori </italic>strains for well-grounded personalized eradication treatment. Taking into account the <italic>H. pylori</italic> genotype, it is plausible to differentiate the pathogen depending on the presence of VacA and CagA positive strains in infected individuals. Patients with precancerous conditions and/or a family history of gastric cancer living in regions endemic for helicobacteriosis have a high risk of contamination with pathogenic strains and the development of gastric cancer. A comparative analysis of <italic>H. pylori</italic> identification methods has revealed a problem in the helicobacteriosis diagnosis consisting in the absence of test systems designed to identify pathogenic strains of the microorganism capable of synthesizing oncogenic proteins. Administration of eradication therapy to all those infected without consideration of <italic>H. рylori </italic>pathogenicity is associated with an increase of antibiotic resistance to the drugs recommended for treatment, the development of dysbiosis and other side effects. According to the results of an experimental study, the use of antimicrobial therapy is justified only 13–20% of the patients. The development of enzyme-linked immune assays, immunochromatographic and other tests system for detection of <italic>H. pylori</italic> pathogenic proteins, seems promising.</p> <p>The use of whole genome sequencing (WGS) of the pathogens to identify the risk groups with potentially ineffective eradication should be considered as progress. Assessment of <italic>H. pylori</italic>‘s sensitivity to antimicrobials before the administration of the first line eradication therapy makes it possible to timely correct the treatment and increase its efficacy.</p></abstract><trans-abstract xml:lang="ru"><p>Согласно положениям консенсуса Маастрихт VI, у пациентов с синдромом диспепсии предпочтительна стратегия «тестируй и лечи» и рекомендовано проведение эрадикационной терапии <italic>Helicobacter pylori.</italic> Однако особенности генотипа микроорганизма, обусловливающие его способность влиять на развитие <italic>H. pylori-</italic>ассоциированных заболеваний, рост антибиотикорезистентности, негативные последствия многокомпонентной терапии пациентов с хеликобактериозом диктуют необходимость пересмотра неоднозначного преимущества стратегии обязательной эрадикации. <bold>Цель</bold> настоящего обзора – анализ диагностических возможностей идентификации патогенных штаммов <italic>H. рylori </italic>для обоснованного персонализированного назначения эрадикационной терапии.</p> <p>С учетом особенностей генотипа <italic>H. pylori</italic> целесообразно дифференцировать микроорганизм по признаку наличия у инфицированных VacA- и СagA-позитивных штаммов. Пациенты с предраковыми состояниями и/или семейным анамнезом рака желудка, проживающие в эндемичных по хеликобактериозу регионах, подвержены высокому риску контаминации патогенными штаммами и развития рака желудка. Сравнительный анализ методов идентификации <italic>H. рylori</italic> выявил проблему диагностики хеликобактериоза, которая заключается в отсутствии тест-систем, предназначенных для определения патогенных штаммов микроорганизма, способных синтезировать онкогенные белки. Назначение клиницистами эрадикационной терапии всем инфицированным, без учета патогенности штаммов <italic>H. рylori,</italic> влечет за собой рост антибиотикорезистентности к рекомендуемым для лечения препаратам, развитие дисбиоза и других побочных эффектов. Согласно данным экспериментального исследования, использование антимикробной терапии целесообразно только у 13–20% пациентов. К перспективным направлениям следует отнести разработку иммуноферментных, иммунохроматографических и других тест-систем, способных детектировать белки патогенности <italic>H. рylori.</italic> Прогрессивным следует считать использование полногеномного секвенирования (whole genome sequencing, WGS) микроорганизма для выделения групп риска с возможной неэффективной эрадикацией. Определение чувствительности <italic>H. pylori</italic> к антимикробным препаратам до назначения первой линии эрадикационной терапии дает возможность своевременно провести коррекцию терапии и повысить эффективность лечения.</p></trans-abstract><kwd-group xml:lang="en"><kwd>Helicobacter pylori</kwd><kwd>CagA pathogenicity protein</kwd><kwd>diagnostic test systems</kwd><kwd>pathogen strain identification problems</kwd><kwd>eradication therapy</kwd><kwd>antibiotic resistance</kwd><kwd>personalized approach</kwd></kwd-group><kwd-group xml:lang="ru"><kwd>Helicobacter pylori</kwd><kwd>белок патогенности CagA</kwd><kwd>диагностические тест-системы</kwd><kwd>проблемы идентификации патогенных штаммов</kwd><kwd>эрадикационная терапия</kwd><kwd>антибиотикорезистентность</kwd><kwd>персонализированный подход</kwd></kwd-group><funding-group/></article-meta></front><body></body><back><ref-list><ref id="B1"><label>1.</label><mixed-citation>Sharndama HC, Mba IE. Helicobacter pylori: An up-to-date overview on the virulence and pathogenesis mechanisms. Braz J Microbiol. 2022;53(1):33–50. doi: 10.1007/s42770-021-00675-0.</mixed-citation></ref><ref id="B2"><label>2.</label><mixed-citation>Hooi JKY, Lai WY, Ng WK, Suen MMY, Underwood FE, Tanyingoh D, Malfertheiner P, Graham DY, Wong VWS, Wu JCY, Chan FKL, Sung JJY, Kaplan GG, Ng SC. Global prevalence of Helicobacter pylori infection: Systematic review and meta-analysis. Gastroenterology. 2017;153(2):420–429. doi: 10.1053/j.gastro.2017.04.022.</mixed-citation></ref><ref id="B3"><label>3.</label><mixed-citation>Li Y, Choi H, Leung K, Jiang F, Graham DY, Leung WK. Global prevalence of Helicobacter pylori infection between 1980 and 2022: A systematic review and meta-analysis. Lancet Gastroenterol Hepatol. 2023;8(6):553–564. doi: 10.1016/S2468-1253(23)00070-5.</mixed-citation></ref><ref id="B4"><label>4.</label><mixed-citation>Ansari S, Yamaoka Y. Helicobacter pylori virulence factors exploiting gastric colonization and its pathogenicity. Toxins (Basel). 2019;11(11):677. doi: 10.3390/toxins11110677.</mixed-citation></ref><ref id="B5"><label>5.</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="en">Bordin DS, Kuznetsova ES, Stouwer EE, Nikolskaya KA, Chebotareva MV, Voinovan IN, Neyasova NA, Livzan MA. [Prevalence of Helicobacter pylori infection in various diseases and cohort studies conducted in the Russian Federation from 1990 to 2023: A systematic review]. Effective Pharmacotherapy. 2024;20(30):24–33. Russian. doi: 10.33978/2307-3586-2024-20-30-24-33.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="ru">Бордин ДС, Кузнецова ЕС, Стаувер ЕЕ, Никольская КА, Чеботарева МВ, Войнован ИН, Неясова НА, Ливзан МА. Распространенность инфекции Helicobacter pylori при различных заболеваниях и в когортных исследованиях, проведенных в Российской Федерации с 1990 по 2023 год: систематический обзор. Эффективная фармакотерапия. 2024;20(30):24–33. doi: 10.33978/2307-3586-2024-20-30-24-33.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="B6"><label>6.</label><mixed-citation>Chen YC, Malfertheiner P, Yu HT, Kuo CL, Chang YY, Meng FT, Wu YX, Hsiao JL, Chen MJ, Lin KP, Wu CY, Lin JT, O'Morain C, Megraud F, Lee WC, El-Omar EM, Wu MS, Liou JM. Global prevalence of Helicobacter pylori infection and incidence of gastric cancer between 1980 and 2022. Gastroenterology. 2024;166(4):605–619. doi: 10.1053/ j.gastro.2023.12.022.</mixed-citation></ref><ref id="B7"><label>7.</label><mixed-citation>Salvatori S, Marafini I, Laudisi F, Monteleone G, Stolfi C. Helicobacter pylori and gastric cancer: Pathogenetic mechanisms. Int J Mol Sci. 2023;24(3):2895. doi: 10.3390/ijms24032895.</mixed-citation></ref><ref id="B8"><label>8.</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="en">Bordin DS, Livzan MA, Osipenko MF, Mozgovoy SI, Andreyev DN, Maev IV. [The key statements of the Maastricht VI consensus]. Experimental and Clinical Gastroenterology. 2022;(9):5–21. Russian. doi: 10.31146/1682-8658-ecg-205-9-5-21.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="ru">Бордин ДС, Ливзан МА, Осипенко МФ, Мозговой СИ, Андреев ДН, Маев ИВ. Ключевые положения консенсуса Маастрихт VI. Экспериментальная и клиническая гастроэнтерология. 2022;(9):5–21. doi: 10.31146/1682-8658-ecg-205-9-5-21.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="B9"><label>9.</label><mixed-citation>Karbalaei M, Talebi Bezmin Abadi A, Keikha M. Clinical relevance of the cagA and vacA s1m1 status and antibiotic resistance in Helicobacter pylori: A systematic review and meta-analysis. BMC Infect Dis. 2022;22(1):573. doi: 10.1186/s12879-022-07546-5.</mixed-citation></ref><ref id="B10"><label>10.</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="en">Yanovich OO, Titov LP, Doroshko MV. [Genetic diversity and functional status of oipA GENE Helicobacter pylori, its association with island of pathogenicity genes in patients with gastroduodenal diseases in the Republic of Belarus]. Molecular Genetics, Microbiology and Virology. 2022;40(4):9–13. Russian. doi: 10.3103/S0891416822040097.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="ru">Янович ОО, Титов ЛП, Дорошко МВ. Генетическое разнообразие и функциональный статус oipA-гена Helicobacter pylori, его ассоциация с генами острова патогенности у пациентов с различными гастродуоденальными заболеваниями в Республике Беларусь. Молекулярная генетика, микробиология и вирусология. 2022;40(4):9–13. doi: 10.3103/S0891416822040097.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="B11"><label>11.</label><mixed-citation>Sedarat Z, Taylor-Robinson AW. Helicobacter pylori outer membrane proteins and virulence factors: potential targets for novel therapies and vaccines. Pathogens. 2024;13(5):392. doi: 10.3390/pathogens13050392.</mixed-citation></ref><ref id="B12"><label>12.</label><mixed-citation>Elbehiry A, Marzouk E, Abalkhail A, Sindi W, Alzahrani Y, Alhifani S, Alshehri T, Anajirih NA, ALMutairi T, Alsaedi A, Alzaben F, Alqrni A, Draz A, Almuzaini AM, Aljarallah SN, Almujaidel A, Abu-Okail A. Pivotal role of Helicobacter pylori virulence genes in pathogenicity and vaccine development. Front Med (Lausanne). 2025;11:1523991. doi: 10.3389/fmed.2024.1523991.</mixed-citation></ref><ref id="B13"><label>13.</label><mixed-citation>Zhang Y, Li X, Shan B, Zhang H, Zhao L. Perspectives from recent advances of Helicobacter pylori vaccines research. Helicobacter. 2022;27(6):e12926. doi: 10.1111/hel.12926.</mixed-citation></ref><ref id="B14"><label>14.</label><mixed-citation>Cover TL, Lacy DB, Ohi MD. The Helicobacter pylori cag type IV secretion system. Trends Microbiol. 2020;28(8):682–695. doi: 10.1016/ j.tim.2020.02.004.</mixed-citation></ref><ref id="B15"><label>15.</label><mixed-citation>Fischer W, Tegtmeyer N, Stingl K, Backert S. Four chromosomal type IV secretion systems in Helicobacter pylori: Composition, structure and function. Front Microbiol. 2020;11:1592. doi: 10.3389/fmicb.2020.01592.</mixed-citation></ref><ref id="B16"><label>16.</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="en">Klimnyuk SI, Kovanova EN, Tvorko MS. [New epigenetic pathway of carcinogenesis associated with Helicobacter pylori]. Gastroenterology. 2015;3(57):116–121. Russian.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="ru">Климнюк СИ, Кованова ЭН, Творко МС. Новый эпигенетический путь канцерогенеза, ассоциированного с Helicobacter pylori. Гастроентерологiя. 2015;3(57):116–121.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="B17"><label>17.</label><mixed-citation>Miernyk KM, Bruden D, Rudolph KM, Hurlburt DA, Sacco F, McMahon BJ, Bruce MG. Presence of cagPAI genes and characterization of vacA s, i and m regions in Helicobacter pylori isolated from Alaskans and their association with clinical pathologies. J Med Microbiol. 2020;69(2):218–227. doi: 10.1099/jmm.0.001123.</mixed-citation></ref><ref id="B18"><label>18.</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="en">Svistunov AA, Osadchuk MA, Mironova ED, Ogibenina ES. [Helicobacter pylori infection as a risk factor for gastrointestinal cancer]. Russian Journal of Preventive Medicine. 2021;24(11):105–111. Russian. doi: 10.17116/profmed202124111105.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="ru">Свистунов АА, Осадчук МА, Миронова ЕД, Огибенина ЕС. Инфекция Helicobacter pylori как фактор риска рака органов пищеварения. Профилактическая медицина. 2021;24(11):105–111. doi: 10.17116/profmed202124111105.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="B19"><label>19.</label><mixed-citation>Сварваль АВ, Старкова ДА, Ферман РС. Детерминанты вирулентности и генотипы клинических изолятов Helicobacter pylori. Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2022;99(6):692–700. doi: 10.36233/0372-9311-298.</mixed-citation></ref><ref id="B20"><label>20.</label><mixed-citation>Matos JI, de Sousa HA, Marcos-Pinto R, Dinis-Ribeiro M. Helicobacter pylori CagA and VacA genotypes and gastric phenotype: A meta-analysis. Eur J Gastroenterol Hepatol. 2013;25(12):1431–1441. doi: 10.1097/MEG.0b013e328364b53e.</mixed-citation></ref><ref id="B21"><label>21.</label><mixed-citation>Sallas M, Melchiades J, Zabaglia L, Moreno J, Orcini W, Chen E, Smith M, Payão S., Rasmussen L. Prevalence of Helicobacter pylori vacA, cagA, dupA and oipA genotypes in patients with gastric disease. Adv. Microbiol. 2017;7:1–9. doi: 10.4236/aim.2017.71001.</mixed-citation></ref><ref id="B22"><label>22.</label><mixed-citation>Al-Ouqaili MTS, Hussein RA, Majeed YH, Al-Marzooq F. Study of vacuolating cytotoxin A (vacA) genotypes of ulcerogenic and non-ulcerogenic strains of Helicobacter pylori and its association with gastric disease. Saudi J Biol Sci. 2023;30(12):103867. doi: 10.1016/ j.sjbs.2023.103867.</mixed-citation></ref><ref id="B23"><label>23.</label><mixed-citation>Elghannam MT, Hassanien MH, Ameen YA, Turky EA, ELattar GM, ELRay AA, ELTalkawy MD. Helicobacter pylori and oral-gut microbiome: Clinical implications. Infection. 2024;52(2):289–300. doi: 10.1007/s15010-023-02115-7.</mixed-citation></ref><ref id="B24"><label>24.</label><mixed-citation>Ali A, AlHussaini KI. Helicobacter pylori: A contemporary perspective on pathogenesis, diagnosis and treatment strategies. Microorganisms. 2024;12(1):222. doi: 10.3390/microorganisms12010222.</mixed-citation></ref><ref id="B25"><label>25.</label><mixed-citation>Skrebinska S, Mégraud F, Bessède E. Diagnosis of Helicobacter pylori infection. Helicobacter. 2018;23 Suppl 1:e12515. doi: 10.1111/hel.12515.</mixed-citation></ref><ref id="B26"><label>26.</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="en">Bakulin IG, Bakulina NV, Vorobyov SL, Popova EA, Malikhova OA, Zeynalova PA, Ilchishina TA, Lozovaya VV, Abbasbeyli FM. [MALT lymphoma and erosive ulcerative lesions of the stomach: current differential diagnostics methods and own clinical observation]. Oncohematology. 2019;14 (3):23–37. Russian. doi: 10.17650/1818-8346-2019-14-3-23-37.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="ru">Бакулин ИГ, Бакулина НВ, Воробьев СЛ, Попова ЕА, Малихова ОА, Зейналова ПА, Ильчишина ТА, Лозовая ВВ, Аббасбейли ФМ. MALT-лимфома и эрозивно-язвенные поражения желудка: современные подходы к дифференциальной диагностике и собственное клиническое наблюдение. Онкогематология. 2019;14(3):23–37. doi: 10.17650/1818-8346-2019-14-3-23-37.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="B27"><label>27.</label><mixed-citation>Brandi G, Biavati B, Calabrese C, Granata M, Nannetti A, Mattarelli P, Di Febo G, Saccoccio G, Biasco G. Urease-positive bacteria other than Helicobacter pylori in human gastric juice and mucosa. Am J Gastroenterol. 2006;101(8):1756–1761. doi: 10.1111/j.1572-0241.2006.00698.x.</mixed-citation></ref><ref id="B28"><label>28.</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="en">Yarkov SP, Shilenko IV, Tretyakov SI, Ishkov YN, Styazhkin KK. [Immunochromatography-based portable equipment for indication of pathogenic microorganisms and toxins]. Extreme Medicine. 2022;24(4):14–22. Russian. doi: 10.47183/mes.2022.046.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="ru">Ярков СП, Шиленко ИВ, Третьяков СИ, Ишков ЮН, Стяжкин КК. Технические средства на основе иммунохроматографии для индикации патогенных микроорганизмов и токсинов. Медицина экстремальных ситуаций. 2022;24(4):14–22. doi: 10.47183/mes.2022.046.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="B29"><label>29.</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="en">Smirnova DN, Bogacheva NV, Petrov SB, Tuneva NA. Comparative assessment of the results of detection of СagА-positive strains of Helicobacter pylori by molecular-genetic and immunochromatographic methods in different biological materials. Klin Lab Diagn. 2022;67(1):48–52. doi: 10.51620/0869-2084-2022-67-1-48-52.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="ru">Смирнова ДН, Богачева НВ, Петров СБ, Тунева НА. Сравнительная оценка результатов выявления СagА-положительных штаммов Helicobacter pylori молекулярно-генетическим и иммунохроматографическим методами в различных биологических материалах. Клиническая лабораторная диагностика. 2022;67(1):48–52. doi: 10.51620/0869-2084-2022-67-1-48-52.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="B30"><label>30.</label><mixed-citation>Gantuya B, El Serag HB, Saruuljavkhlan B, Azzaya D, Matsumoto T, Uchida T, Oyuntsetseg K, Oyunbileg N, Davaadorj D, Yamaoka Y. Advantage of 16S rRNA amplicon sequencing in Helicobacter pylori diagnosis. Helicobacter. 2021;26(3):e12790. doi: 10.1111/hel.12790.</mixed-citation></ref><ref id="B31"><label>31.</label><mixed-citation>Zhu F, Zhang X, Li P, Zhu Y. Effect of Helicobacter pylori eradication on gastric precancerous lesions: A systematic review and meta-analysis. Helicobacter. 2023;28(6):e13013. doi: 10.1111/hel.13013.</mixed-citation></ref><ref id="B32"><label>32.</label><mixed-citation>Lee HS. Histopathologic diagnosis of H. pylori infection and associated gastric diseases. In: Kim N., ed. Helicobacter pylori. Springer, Singapore; 2023. doi: 10.1007/978-981-97-0013-4_9.</mixed-citation></ref><ref id="B33"><label>33.</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="en">Gasymova MC, Gurbanov AI. [Comparative evaluation of serological investigation methods in H. pylori-associated gastric and duodenal ulcer diseases]. Meditsinskie Novosti. 2020;(5):82–84. Russian.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="ru">Гасымова МЧ, Гурбанов АИ. Сравнительная характеристика серологических методов исследования при Helicobacter pylori-ассоциированной язвенной болезни желудка и двенадцатиперстной кишки. Медицинские новости. 2020;(5):82–84.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="B34"><label>34.</label><mixed-citation>Karlsson R, Thorell K, Hosseini S, Kenny D, Sihlbom C, Sjöling Å, Karlsson A, Nookaew I. Comparative analysis of two Helicobacter pylori strains using genomics and mass spectrometry-based proteomics. Front Microbiol. 2016;7:1757. doi: 10.3389/fmicb.2016.01757.</mixed-citation></ref><ref id="B35"><label>35.</label><mixed-citation>Yin S, Liu Y, Yang X, Lubanga N, Tai P, Xiong M, Fan B, Yang X, Nie Z, Zhang Q, He B. Rapid visual detection of Helicobacter pylori and vacA subtypes by dual-target RAA-LFD assay. Clin Chim Acta. 2025;564:119927. doi: 10.1016/ j.cca.2024.119927.</mixed-citation></ref><ref id="B36"><label>36.</label><mixed-citation>Gagan J, Van Allen EM. Next-generation sequencing to guide cancer therapy. Genome Med. 2015;7(1):80. doi: 10.1186/s13073-015-0203-x.</mixed-citation></ref><ref id="B37"><label>37.</label><mixed-citation>Cardos AI, Maghiar A, Zaha DC, Pop O, Fritea L, Miere Groza F, Cavalu S. Evolution of diagnostic methods for Helicobacter pylori infections: From traditional tests to high technology, advanced sensitivity and discrimination tools. Diagnostics (Basel). 2022;12(2):508. doi: 10.3390/diagnostics12020508.</mixed-citation></ref><ref id="B38"><label>38.</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="en">Akhmetova DG, Baltabekova AZh, Shustov AV. [Antibiotic resistance of Helicobacter pylori: review of epidemiological trends and problems of treatment]. Russian Medical Inquiry. 2018;7–1:13–18. Russian.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="ru">Ахметова ДГ, Балтабекова АЖ, Шустов АВ. Устойчивость к антибиотикам Helicobacter pylori: обзор эпидемиологических тенденций и проблемы терапии. РМЖ. Медицинское обозрение. 2018;7–1:13–18.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="B39"><label>39.</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="en">Lazebnik LB, Dekhnich NN, Sitkin SI, Atrushevich VG, Avalueva EB, Bakulin IG, Bakulina NV, Baryshnikova NV, Belousova LN, Bordin DS, Veselov AV, Grinevich VB, Gurova MM, Eremina EYu, Ivanchik NV, Kozlov RS, Kozlova IV, Kornienko EA, Kravchuk YuA, Kupriyanova IN, Kucheryavy YuA, Levitan BN, Livzan MA, Luzina EV, Lyalyukova EA, Novikova VP, Ostroumova OD, Pilat TL, Sarsenbaeva AS, Sychev DA, Tryapyshko AA, Trukhan DI, Turkina SV, Uspensky YuP, Fedorchenko YuL, Fominykh YuA, Khavkin AI, Khlynova OV, Khomeriki SG, Khomeriki NM, Shevyakov MA. [Helicobacter pylori, helicobacteriosis and associated diseases (VIII Moscow Agreements on the diagnosis and treatment of helicobacteriosis in adults and children). A Clinical Guide for Physicians]. Experimental and Clinical Gastroenterology. 2024;(12):49–145. Russian. doi: 10.31146/1682-8658-ecg-232-12-49-145.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="ru">Лазебник ЛБ, Дехнич НН, Ситкин СИ, Атрушевич ВГ, Авалуева ЕБ, Бакулин ИГ, Бакулина НВ, Барышникова НВ, Белоусова ЛН, Бордин ДС, Веселов АВ, Гриневич ВБ, Гурова ММ, Еремина ЕЮ, Иванчик НВ, Козлов РС, Козлова ИВ, Корниенко ЕА, Кравчук ЮА, Куприянова ИН, Кучерявый ЮА, Левитан БН, Ливзан МА, Лузина ЕВ, Лялюкова ЕА, Новикова ВП, Остроумова ОД, Пилат ТЛ, Сарсенбаева АС, Сычев ДА, Тряпышко АА, Трухан ДИ, Туркина СВ, Успенский ЮП, Федорченко ЮЛ, Фоминых ЮА, Хавкин АИ, Хлынова ОВ, Хомерики СГ, Хомерики НМ, Шевяков МА. Helicobacter pylori, хеликобактериоз и ассоциированные заболевания (VIII Московские соглашения по диагностике и лечению хеликобактериоза у взрослых и детей). Руководство для врачей. Экспериментальная и клиническая гастроэнтерология. 2024;(12):49–145. doi: 10.31146/1682-8658-ecg-232-12-49-145.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="B40"><label>40.</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="en">Andreev DN, Maev IV, Kucheryavyy YA. [Helicobacter pylori resistance in the Russian Federation: a meta-analysis of studies over the past 10 years]. Therapeutic Archive. 2020;92(11):24–30. Russian.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="ru">Андреев ДН, Маев ИВ, Кучерявый ЮА. Резистентность Helicobacter pylori в Российской Федерации: метаанализ исследований за последние 10 лет. Терапевтический архив. 2020;92(11):24–30.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="B41"><label>41.</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="en">Neumoina MV, Perfilova KM, Neumoina NV, Shutova IV, Troshina TA, Shmakova TV, Denisenko TL. Resistance of helicobacter pylori to antibacterial medications as a risk factor of infection development. Health Risk Analysis. 2020;(2):175–184. doi: 10.21668/health.risk/2020.2.19eng.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="ru">Неумоина МВ, Перфилова КМ, Неумоина НВ, Шутова ИВ, Трошина ТА, Шмакова ТВ, Денисенко ТЛ. Проблема резистентности Helicobacter pylori к антибактериальным препаратам как фактор риска прогрессирования инфекции. Анализ риска здоровью. 2020;(2):175–184. doi: 10.21668/health.risk/2020.2.19.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="B42"><label>42.</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="en">Pozdeeva AO, Pozdeev OK, Gulyaev PE, Valeeva YV, Savinova AN. [Current development of Helicobacter pylori eradication protocols]. Russian Journal of Infection and Immunity. 2021;11(6):1037–1049. Russian. doi: 10.15789/2220-7619-CDO-1679.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="ru">Поздеева АО, Поздеев ОК, Гуляев ПЕ, Валеева ЮВ, Савинова АН. Современное развитие схем эрадикации Helicobacter pylori. Инфекция и иммунитет. 2021;11(6):1037–1049. doi: 10.15789/2220-7619-CDO-1679.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="B43"><label>43.</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="en">Ivashkin VT, Mayev IV, Kucheryavy YuA, Lapina TL, Baranskaya YeK, Osipenko MF, Livzan MA, Grinevich VB, Sas YeI, Drapkina OM, Sheptulin AA, Abdulganiyeva DI, Alekseyeva OP, Korochanskaya NV, Mordasova VI, Poluektova YeA, Prokhorova LV, Trukhmanov AS, Faizova LP, Cheremushkin SV. [Management of abdominal pain: clinical guidelines of the Russian gastroenterological association]. Russian Journal of Gastroenterology, Hepatology, Coloproctology. 2015;25(4):71–80. Russian.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="ru">Ивашкин ВТ, Маев ИВ, Кучерявый ЮА, Лапина ТЛ, Баранская ЕК, Осипенко МФ, Ливзан МА, Гриневич ВБ, Сас ЕИ, Драпкина ОМ, Шептулин АА, Абдулганиева ДИ, Алексеева ОП, Корочанская НВ, Мордасова ВИ, Полуэктова ЕА, Прохорова ЛВ, Трухманов АС, Фаизова ЛП, Черемушкин СВ. Клинические рекомендации Российской гастроэнтерологической ассоциации по ведению пациентов с абдоминальной болью. Российский журнал гастроэнтерологии, гепатологии, колопроктологии. 2015;25(4):71–80.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="B44"><label>44.</label><mixed-citation>Salahi-Niri A, Nabavi-Rad A, Monaghan TM, Rokkas T, Doulberis M, Sadeghi A, Zali MR, Yamaoka Y, Tacconelli E, Yadegar A. Global prevalence of Helicobacter pylori antibiotic resistance among children in the world health organization regions between 2000 and 2023: A systematic review and meta-analysis. BMC Med. 2024;22(1):598. doi: 10.1186/s12916-024-03816-y.</mixed-citation></ref><ref id="B45"><label>45.</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="en">Gorbich OA, Gorbich YuL, Karpov IA, Gurinovich NS, Glaz OC. [Clostridioides difficile associated diarrhea]. Meditsinskie Novosti. 2020;(9):77–79. Russian.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="ru">Горбич ОА, Горбич ЮЛ, Карпов ИА, Гуринович НС, Глаз ОЧ. Clostridioides difficile-ассоциированная диарея. Медицинские новости. 2020;(9):77–79.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="B46"><label>46.</label><mixed-citation>Sitkin S, Lazebnik L, Avalueva E, Kononova S, Vakhitov T. Gastrointestinal microbiome and Helicobacter pylori: Eradicate, leave it as it is, or take a personalized benefit-risk approach? World J Gastroenterol. 2022;28(7):766–774. doi: 10.3748/wjg.v28.i7.766.</mixed-citation></ref><ref id="B47"><label>47.</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="en">Livzan MA. [Underwater rocks of anti-helicobacter therapy]. Therapeutic Archive. 2019;91(8):141–147. Russian. doi: 10.26442/00403660.2019.08.000386.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="ru">Ливзан М.А. Подводные камни антихеликобактерной терапии. Терапевтический архив. 2019;91(8):141–147. doi: 10.26442/00403660.2019.08.000386.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="B48"><label>48.</label><mixed-citation>Salih BA, Karakus C, Yazici D, Ulupinar Z, Akbas F, Yucel F, Akcael E, Akcan Y. Development of an in-house capture ELISA: An attempt to detect CagA antigen in sera of Helicobacter pylori infected patients. J Immunol Methods. 2021;488:112905. doi: 10.1016/j.jim.2020.112905.</mixed-citation></ref><ref id="B49"><label>49.</label><mixed-citation>Zhou Y, Zhong Z, Hu S, Wang J, Deng Y, Li X, Chen X, Li X, Tang Y, Li X, Hao Q, Liu J, Sang T, Bo Y, Bai F. A Survey of Helicobacter pylori antibiotic-resistant genotypes and strain lineages by whole-genome sequencing in China. Antimicrob Agents Chemother. 2022;66(6):e0218821. doi: 10.1128/aac.02188-21.</mixed-citation></ref></ref-list></back></article>
